读取p值的.csv文件时，如何忽略/转换某些输入？

Question

我试图读取包含节点数据（主要是p值）的.csv文件到我的程序中，但这样做我必须将它们从字符串转换为双精度。下面是它的方法：

public ArrayList<Node> getCSVFile(String file){ 


     String csvFile = file; 
     BufferedReader br = null; 
     String line = ""; 
     String cvsSplitBy = ","; 
     ArrayList<Node> nL = new ArrayList<Node>(); 
     int count = 0; 

     try { 

      br = new BufferedReader(new FileReader(csvFile)); 
      while ((line = br.readLine()) != null) { 

        // use comma as separator 
       String[] node = line.split(cvsSplitBy); 


       double pVal = Double.parseDouble(node[4]); 
       nL.add(new Node(count, node[0], pVal)); 

       count++; 
      } 

     } catch (FileNotFoundException e) { 
      e.printStackTrace(); 
     } catch (IOException e) { 
      e.printStackTrace(); 
     } finally { 
      if (br != null) { 
       try { 
        br.close(); 
       } catch (IOException e) { 
        e.printStackTrace(); 
       } 
      } 
     } 

    return nL; 
} 

目标节点是参数为节点（INT，字符串，双），但我想转换的文件的第一行是列名，和我不完全确定之后的条目的性质。下面就一起来看看该文件的开头：

基因，COMMON，gal1RGexp，gal4RGexp，gal80Rexp，gal1RGsig，gal4RGsig，gal80Rsig YHR051W，COX6，-0.034,0.111，-0.304,3.75720e-01,1.56240 e-02,7.91340e-06 YHR124W，NDT80，-0.090,0.007，-0.348,2.71460e-01,9.64330e-01,3.44760e-01 YKL181W，PRS1，-0.167，-0.233,0.112,6.27120e -03,7.89400e-04,1.44060e-01 YGR072W，UPF3,0.245，-0.471,0.787,4.10450e-04,7.51780e-04,1.37130e-05 YHL020C，OPI1,0.174，-0.015,0.151， 1.40160e-04,7.19120e-01,1.53950e-02 YGR145W，YGR145W，0.387，-0.577，-0.088,5.37920e-03,8.27330e-03,7.64180e-01 YGL041C，YGL041C，0.285，-0.086 ，0.103,4.46050e-04,4.50790e-01,7.03040e-0 1 YGR218W，CRM1，-0.018，-0.001，-0.018,6.13810e-01,9.79400e-01,8.09690e-01 YOR202W，HIS3，-0.432，-0.710,0.239,1.09790e-02,1.79790e- 04,5.48950e-03 YCR005C，CIT2,0.085,0.392,0.464,4.18980e-02,1.53050e-06,2.74360e-06 YER187W，KHS1,0.159,0.139，-0.045,8.51260e-04,4.17830e -0.3,6.18020e-01 YBR026C，YBR026C，0.276,0.189,0.291,3.63320e-05,6.15230e-04,1.24430e-03 YMR244W，YMR244W，0.078，-0.239，-0.072,5.76050e-01， 3.55240e-01,8.85690e-01 等等等等。

因此，代码为基于所述第一和第五列的每一行，以及独特的计数器创建节点。但是，我怎样才能跳过只有列名的第一行？我有点犹豫，只是略过所有文件中的所有第一行，因为并非所有读取的文件都可能有字符串作为第一行。即使如此，下面几行适合转换为双打？

谢谢！

Answer 1

解析double时跳过行是不可能的？ 像这样：

public ArrayList<Node> getCSVFile(String file){ 
    String csvFile = file; 
    BufferedReader br = null; 
    String line = ""; 
    String cvsSplitBy = ","; 
    ArrayList<Node> nL = new ArrayList<Node>(); 
    int count = 0; 

    try { 

     br = new BufferedReader(new FileReader(csvFile)); 
     while ((line = br.readLine()) != null) { 

       // use comma as separator 
      String[] node = line.split(cvsSplitBy); 
      double pVal; 

      try { 
       pVal = Double.parseDouble(node[4]); 
      } catch (NumberFormatException e) { 
       continue; // Skip this line if this isn't a double 
      } 

      nL.add(new Node(count, node[0], pVal)); 

      count++; 
     } 

    } catch (FileNotFoundException e) { 
     e.printStackTrace(); 
    } catch (IOException e) { 
     e.printStackTrace(); 
    } finally { 
     if (br != null) { 
      try { 
       br.close(); 
      } catch (IOException e) { 
       e.printStackTrace(); 
      } 
     } 
    } 

    return nL; 
} 

Answer 2

更改现有的方法来签名：

public ArrayList<Node> getCSVFile(String file, int startAt){ 

，并使用startAt你读的循环来控制多少行被跳过的内部。我建议创建一个返回所有行默认的方法：

public ArrayList<Node> getCSVFile(String file){ 
    return getCSVFile(file, 0); 
} 

或者这可能是一个布尔值，如果你知道，你要么要跳过第一行或根本没有。

至于你的问题的第二部分，许多这些字符串将不会被解析。您可能想要阅读this。但我不确定你希望如何解析或使用像'YHR051W'这样的值（因为你说你想要第一列）。