在Markdown中运行Python代码

关于在Markdown文档中使用Python代码有很多信息。但这一切似乎都是关于演示Python片段，而不是创建好看的文档。在Markdown中运行Python代码

难道我不能在单个文档中使用Python和Markdown，就像使用R和Markdown一样？

MWE：

Output some text from Python in **Markdown**: 
```python 
from sklearn.datasets import load_iris 
from sklearn import tree 
iris = load_iris() 
clf = tree.DecisionTreeClassifier() 
clf = clf.fit(iris.data, iris.target) 
print(clf.predict_proba(iris.data[:1, :])) 
```

编译如下：markdown_py markdown.txt

<p>Output some text from Python in <strong>Markdown</strong>: 
<code>python 
from sklearn.datasets import load_iris 
from sklearn import tree 
iris = load_iris() 
clf = tree.DecisionTreeClassifier() 
clf = clf.fit(iris.data, iris.target) 
clf.predict_proba(iris.data[:1, :])</code></p>

它显示的代码（凉），但不实际运行它。

你不能在Markdown中运行Python代码吗？如果不是，还有什么替代方案？

（使用Ubuntu的蟒蛇，降价包）。

来源

2015-10-16 Ricardo Cruz

Markdown只是一种文本标记格式。可能有也可能没有库也执行嵌入在这些文档中的代码，但默认情况下，这超出了Markdown的范围。使用ReST标记的狮身人面像可以执行这样的代码IIRC;我不知道Markdown是否存在同样的问题。 – deceze

谢谢。但是ReST没有做我想做的事。它似乎是docbook的替代品。生成文档很酷，但不生成文档和演示文稿。我想在markdown中运行python代码，就像你可以用R做的一样。（见下面的答案） –

我想你想使用Jupyter/IPython Notebook：https：//jupyter.org/，或者如果你希望使用Beaker，语言支持：http://beakernotebook.com/ – Leo

好吧，我只是找到了一个解决方案：

使用块为：

<<engine='python', engine.path='python3'>>= 
# python code 
@

的engine.path默认使用python可执行文件，在大多数Linux系统中仍然是python2。如果你想要Python 2，你可以省略它。
如果你想省略代码打印输出和results='asis'，不要忘记通过echo=FALSE，这样它就不会尝试转义输出。

您可以使用以下块在文档的beggining来设置的默认值：

<<r setup, include=FALSE>>= 
knitr::opts_chunk$set(echo=FALSE, engine='whathaveyou', ...) 
@

将文件另存为markdown.Rmd，并使用R 2与knitr编译它。它将使用python运行Python代码。

R指令：rmarkdown::render('markdown.Rmd','output.html')

或者只是使用RStudio。

附录：原生解决方案显然是Pweave：它与乳胶和降价。尽管如此，我还没有尝试过。

来源

2015-10-16 09:08:46

那么你在块中使用R代码的Python代码语法，如--- {r} ---？（三个口音没有出现在评论中出于某种原因，所以我用三个破折号替换） – lara

@lara，我已经添加了关于如何做的信息。 –

在Markdown中运行Python代码

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