从列表中提取行给出两个条件

我有什么：我有一个列表，nodes。每个列表具有以下结构：从列表中提取行给出两个条件

nodes = [[ID, number 1, number 2, number 3],[...]]

我也有列出称为sampleID和sampleID2其中每个列表可以仅具有等于属于包含在总IDs的一个子集的ID数单数据的其他两个列表nodes：

sampleID = [[IDa],[...]] 
sampleID2 = [[IDb],[...]], len(sampleID) + len(sampleID2) <= len(nodes)

在某些情况下，这些名单，也可以像：

sampleID = [[IDa1,IDa2, IDa3,...],[...]]

我想要什么：鉴于上述三个列表，我想在一个快速的方式得到包含其中IDi==ID，I = A，B名单第四列表：

extractedlist = [[ID, number 1, number 2, number 3],[...]], len(extractedlist) = len(sampleID) + len(sampleID2)

我的代码：非常基本的，它的工作原理，但它需要花费大量的时间来计算：

import itertools 
for line in nodes[:]: 
    for line2,line3 in itertools.izip(sampleID[:],sampleID2[:]): 
     for i in range(0,len(line2)): 
      if line2[i]==line[0]: 
       extractedlist.append([line[0], line[1], line[2], line[3]]) 
     for j in range(0,len(line3)): 
      if line3[j]==line[0]: 
       extractedlist.append([line[0], line[1], line[2], line[3]])

来源

2013-09-26 jpcgandre

我不明白你的问题很好，但是这是我理解：P

node = [ .... ] 
sampleID = [ .... ] 
sampleID2 = [ .... ] 
final_ids = [] 
[final_ids.extend(list_item) for list_item in sampleID] 
[final_ids.extend(list_item) for list_item in sampleID2] 

extractedlist = [] 

for line in nodes: 
    if line[0] in final_ids: 
     extractedlist.append(line)

希望这是你所需要的。否则只是添加原有的输入列表和结果列表的问题，所以我可以理解你想要做什么:)

来源

2013-09-26 10:41:05

它的工作原理。但是，如果不是'sampleID = [[IDa]，[...]]'sampleID'是'sampleID = [[IDa1，IDa2，IDa3，...]，[...]]'，它也工作？ 'sampleID'每行通常可以有一个ID，但在某些情况下，每行最多可以有16个ID。谢谢 – jpcgandre

是的，它是有效的，因为来自list sampleID的所有值都在扩展final_ids，因此sampleID中的任何类型列表都可以工作。如果SampleId是这样的 'sampleID = [[IDa1，IDa2，IDa3，... Id16]，[Id17，Id18]，[ID19]，[Id20，Id21，... Id31]]' Then也将其工作:) –

从列表中提取行给出两个条件

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