我试图在我的笔记本电脑(MacBook Pro 10.5.8,MPICH2-1.1)上安装PETSc-3.2,并且在运行测试时遇到了一些困难:它从系统调用到getdomainname()
的错误返回了错误的地址。getdomainname()返回MPI下的错误地址(测试PETSc库)
[-1]PETSC ERROR: --------------------- Error Message ------------------
[-1]PETSC ERROR: Error in system call!
[-1]PETSC ERROR: getdomainname()!
[-1]PETSC ERROR: ------------------------------------------------------
探讨,我写了下面的测试代码使用和不使用MPI检查的getdomainname()
功能:
单处理器:
#include <unistd.h>
#include <stdio.h>
#include <errno.h>
#include <string.h>
#include <limits.h>
#include <stdlib.h>
int main(int argc, char **argv)
{
char *name;
int namelen = CHAR_MAX;
name = (char*) calloc (namelen,sizeof(char));
int err = getdomainname(name,namelen);
printf("%s\n",strerror(errno));
printf("Domain name: %s\n",name);
return err;
}
并行:
/* Headers */
#include "mpi.h"
int main(int argc, char **argv)
{
MPI_Init(&argc,&argv);
int myrank;
char *mpi_name;
int mpi_namelen = MPI_MAX_PROCESSOR_NAME;
mpi_name = (char*) calloc (mpi_namelen,sizeof(char));
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&myrank);
int mpi_err = MPI_Get_processor_name(mpi_name,&mpi_namelen);
printf("MPI_Get_processor_name [%d]: %s\n",mpi_err,mpi_name);
char *name;
int namelen = CHAR_MAX;
name = (char*) calloc (namelen,sizeof(char));
int err = getdomainname(name,namelen);
printf("%s\n",strerror(errno));
printf("Domain name: %s\n",name);
return err;
MPI_Finalize();
}
单处理器代码没有问题,并行代码得到正确的n即使与mpirun -np 1
一起运行,也会返回getdomainname()
的错误地址。
有没有人遇到过这样的问题? mpirun
是否需要进行某种配置,以便为MPI生成的每个进程设置域名?提前致谢!
更新:
对于运行到这个问题的PETSc,编译选项--with-debugging=0
。似乎在一些PETSc调试消息中,他们使用getdomainname()
而不是MPI_Get_processor_name()
。在不调试的情况下编译禁用库中的这个分支。
这是x86_64还是IA-32系统? MPI编译器和非MPI测试是否适用于不同的体系结构? –
好的通话,我甚至没有想到!我的MPI编译器自动使用'-m64'。我用'-m64'重新编译了我的单处理器代码,并且它停止工作了...是解决这个问题的一种方法,还是应该编译所有没有'-m64'的东西?请把它放在一个答案中。 – Mosby