在R中绘制定向多图形

我从来没有在R中使用任何图形绘图包，我熟悉基本绘图命令和ggplot2包。我发现的（但还没有试用过）是Rgraphviz，network和igraph包。所以，我想问问你，这包有简单的学习曲线，满足下列要求：在R中绘制定向多图形

拥有简单的布局引擎（春季布局，随机，...）
试图得出两者之间的多条边顶点，以便它们不会重叠。作为奖励，它能很好地调整这一点。
可以画循环。
顶点和边缘标签，顶点和边的大小和颜色都可以调整。
（无需任何像链接分析，最短路径，最大流量等，但不错的图形算法，如果存在的话）

来源

2011-04-04 Timo

的igraph包似乎满足您的要求，与tkplot()功能帮助调整如果需要最终的布局。

下面是使用的例子：

s <- cbind(A=sample(letters[1:4], 100, replace=TRUE), 
      B=sample(letters[1:2], 100, replace=TRUE)) 
s.tab <- table(s[,1], s[,2]) 
library(igraph) 
s.g <- graph.incidence(s.tab, weighted=T) 
plot(s.g, layout=layout.circle, 
    vertex.label=c(letters[1:4],letters[2:1]),  
    vertex.color=c(rep("red",4),rep("blue",2)), 
    edge.width=c(s.tab)/3, vertex.size=20, 
    vertex.label.cex=3, vertex.label.color="white")

enter image description here

使用交互式显示屏（有使用rgl 3D显示的可能性），它看起来像（我稍微移动一个顶点之后）：

tkplot(s.g, layout=layout.circle, vertex.color=c(rep("red",4),rep("blue",2)))

enter image description here

最后，您甚至可以将图表导出为最常见的格式，例如graphviz的dot。

来源

2011-05-01 17:50:11 chl

感谢。当我需要再次绘制图表时，我会尝试igraph！仅仅为了一些信息，在我问了这个问题后，我和RGraphviz一起去了，并且通过重新编写我的原始任务，摆脱了绘制多边的需求。 – Timo 2011-05-02 13:06:12

@Timo很高兴听到您用graphviz找到自己的方式。我也使用它很多。这只是'igraph'是最强大的，IMO。（顺便说一句，我的+1给你的Q，当我回答时，我没有投票）---) – chl 2011-05-02 13:24:49

multigraph R软件包也很有用。对于上述示例bmgraph重复这样图表：

library("multigraph") 
bmgraph(s.tab, layout = "circ", pch = 16:16, pos = 0, vcol = 6:7, lwd = 3, cex = 9)

而对于定向版本：

bmgraph(s.tab, "circ", pch = 16:16, pos = 0, vcol = 6:7, lwd = 3, cex = 9, directed = TRUE)

来源

2016-09-16 12:44:35 JARO

在R中绘制定向多图形

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