运行第一个程序时出现BIO-Perl错误

Question

我试图使用Eclipse运行bio perl。

我试图执行的代码是：

use Bio::Seq; 
$seq_obj = BIO::Seq->new(-seq=> "atcgatgcatgcatgcatgc", -alphabet=> 'dna'); 
#print $seq_obj->seq; 

而且我得到了以下错误：

Can't locate object method "new" via package "BIO::Seq" (perhaps you forgot to load "BIO::Seq"?) at C:/2ndSemester/BIO424-DevelopBioinformaticTools/PerlPrograms/BIOPerlExamples/TestBIOPerl1.pl line 3.

任何人知道为什么这个错误发生？

Answer 1

该类别被称为Bio::Seq，而不是BIO::Seq。 Perl区分大小写，所以你想说：

$seq_obj = Bio::Seq->new(-seq=> "atcgatgcatgcatgcatgc", -alphabet=> 'dna'); 

注意“生物”，而不是“生物”。