重新排序行文件

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我想知道是否有重新安排在一个文件中的行的方式：重新排序行文件

我有一些原子坐标文件，在一条线上的每个原子，我需要一些原子写在别人面前。假设：

atom c1 
atom c2 
atom c3

我需要重新排序行数。例如：

atom c2 
atom c1 
atom c3

有没有办法做到这一点没有列表？

即使创建一个列表，我没有成功。最后的审判是：

i = open("input.pdb", "r") 
o = open("output.pdb", "w") 
l = [] 
for line in i: 
    l. append(line.split()) 
    for line in l: 
     if "atom c2" in line: 
     a = l.index(line) 
     b = int(a) -1 
     l[a] = l[b] 
for line in l: 
    0.write("{}\n".format(line)) 
o.close() 
os.remove("input.pdb")

任何想法？

来源

2014-02-17 user3320927

你应该发布整个家庭作业练习 – leon

'0.write'？你的意思是'o.write'？ – Blorgbeard

如果这是您的代码缩进的方式，那么if：原子c2在行中：block是空的，其后的所有代码将始终执行。 – IanAuld

比方说，你既然没有给出其他指示，你事先知道什么顺序线应该被写入。

atom c1 # line 0 
atom c2 # line 1 
atom c3 # line 2

在你的榜样，那将是1, 0, 2。然后，而不是for line in l（另外，请never name a variable "l"!），你可以反过来遍历你的行索引列表，并写每个相应的行。

with open("input.pdb", "r") as infile: 
    lines = [line for line in infile] # Read all input lines into a list 

ordering = [1, 0, 2] 
with open("output.pdb", "w") as outfile: 
    for idx in ordering: # Write output lines in the desired order. 
     outfile.write(lines[idx])

来源

2014-02-17 22:36:14

重新排序行文件

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