请问Pymol是否允许用户通过用户定义的值设置原子颜色？ 例如，我想通过它们的生物化学特征对所有原子着色，羽毛被认为是RGB值，比方说[R G B]等于[feature1特征2特征3]，我怎样才能在Pymol中做到这一点？如何在Pymol中设置RGB颜色
另外，如果我已经对原子着色了，我可以得到颜色值吗？我尝试使用cmd.getcolor（），但它返回的值不被识别为RGB颜色，Pymol中是否还有其他任何可用于获取原子颜色的函数 ？
请参阅pymolwiki页面Color和Set Color。
首先，定义一组的使用特征（记住正常化您的特征值成比例[0,1]，或[0,255]）颜色：
set_color mycol1, [feature1R, feature1G, feature1B]
set_color mycol2, [feature2R, feature2G, feature2B]
...
然后，可以着色的原子使用自定义颜色：
# color all alpha Carbons to mycol1:
color mycol1, n. CA
# color all backbone Nitrogens to mycol2:
color mycol1, n. N
要获得原子颜色，请参阅“Getting Atom Colors”。 假设你有一个名为youratom原子和你想要得到的颜色吧：
atomcolor = []
iterate youratom, atomcolor.append(cmd.get_color_tuple(color))
print atomcolor[0]
atomcolor[0]是规模[0,1]与RGB值的元组。