匹配连字符/破折号旁边某些字母

输入文件：匹配连字符/破折号旁边某些字母

>AMSF107-09|Perciformes|COI-5P|GU661092 
TAGTA- 
>AMSF114-09|Perciformes|COI-5P|GU661101 
C-ACGC 
>ANGBF3683-12|Haemulon_sp._B_JJT-2012|COI-5P|JQ741244 
-GCAGTT-CA-

我想替换连字符TAGTA-，C-ACGC，并-GCAGTT-CA-与N的，但离开头（与>开始的行）完整。我正在寻找一个匹配A,C,G或T旁边的连字符的正则表达式，但排除以>字符开头的匹配项。

所需的输出

>AMSF107-09|Perciformes|COI-5P|GU661092 
TAGTAN 
>AMSF114-09|Perciformes|COI-5P|GU661101 
CNACGC 
>ANGBF3683-12|Haemulon_sp._B_JJT-2012|COI-5P|JQ741244 
NGCAGTTNCAN

编辑：我知道正则表达式中最基础的。到目前为止，我已经尝试(ACGT)?\-(ACGT)?，但匹配每个连字符。

来源

2017-08-08 cooldood3490

对，你到目前为止尝试过什么？ – Utkanos

我只知道关闭正则表达式 – cooldood3490

这由A，C，G或T之前连字符相匹配：(?<=[ACGT])-

来源

2017-08-08 17:59:40 gribvirus74

的基本知识，但它也与第3个标题中的T匹配。 '> ANGBF3683-12 | Haemulon_sp._B_JJT-2012 | COI-5P | JQ741244' – cooldood3490

你在写什么语言？您可以添加一个简单的方法来过滤行 – gribvirus74

我正在使用查找和替换功能编辑Sublime中的文本文件。我在查找部分放置正则表达式，在替换部分放置'N'。 – cooldood3490

所以这并不完全找到刚才的连字符，但它会找到任何组合A，C，G，T包括- 。这里是regex：

(?=[ACGT-]+$)(?=(?:[^-]*[-])+).*

您可能需要split这场比赛string断并将其保存到一个临时变量，你那么做了.replace('-', 'N');并连接回到您的数据字符串的结尾。希望这可以帮助！

来源

2017-08-08 23:51:27

等等，这不太对。我以为我测试过它，但它仍然有一个错误。我会看看我是否可以修复它，但它接近！问题是，只要你的任何给定字符已经存在于字符串中，你就可以放入任何字符或数字。我会继续努力工作。 –

@ cooldood3490不小心粘贴了错误的'regex'，它现在被更新了。 –

我感谢您的帮助 – cooldood3490

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