在多个文件上运行命令并改变输入文件的输出文件名称

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我希望对目录中的多个文件执行管道命令。在多个文件上运行命令并改变输入文件的输出文件名称

grep -r Chr18 C* | awk '$2>=1600000&&$2<=1700000' > nameDependentOnInputFile.txt

我希望运行命令的每个文件都以C开头，所以我应该能够使用*在所有这些文件上运行命令。如何根据输入文件更改输出文件名？我也看到，我可以覆盖最初的文件，但这是不可取的。

来源

2015-10-12 Ryan Zapotocny

是在同一个目录下的文件？他们都是文本文件（C.txt），你是否想在160000-170000之间得到'$ 2'＃？ – Chris

是的，所有的文件都在同一个目录下，它们都是cov_af文件...但输出应该是.txt –

所以，如果你想在一个目录下$2是16万和17万之间只打印这些文件，然后像下面应该工作：

for f in /path/to/files/*.cov_af ; do 
bname=`basename $f` 
pref=${bname%%.txt} 
awk '$2 >= 160000 && $2 <= 170000' $f > /path/to/store/output/${pref}_new.txt 
done

来源

2015-10-12 21:04:34 Chris

如果你打算使用'basename'，你可以去'pref = $（basename“$ f“.txt）'并保存一行。 'basename'可以自行剥离后缀。否则，我会建议'bname = $ {f ## * /}; PREF = $ {BNAME％的.txt}'。不要忘记引用你的变量。 –

解决方案效果很好！我确实使用了上述意见建议 –

感谢您的反馈，我很高兴它工作:)。 – Chris

在多个文件上运行命令并改变输入文件的输出文件名称

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