检索使用for循环的两个数据帧之间的匹配行

我一直在试图做到这一点，但没有得到任何地方。任何帮助将非常感激。检索使用for循环的两个数据帧之间的匹配行

df1 <- data.frame(chrom = "chr1", start=c(10,20,30), end = c(100,200,300), stringsAsFactors=FALSE) 
df2 <- data.frame(chrom = c("chr1", "chr2", "chr3"),start=c(15,500,150), end = c(75,1000,300), stringsAsFactors=FALSE)

我想去的地方df1$chrom == df2$chrom获得DF2的所有行。或者更好的是：我想在一个新的向量中生成输出，并显示df1后跟df2或反之亦然的行，其中df1$chrom == df2$chrom。

我已经尝试了这个使用for循环如下：

for(i in 1:nrow(df2)){ 
    x[i] <- df2[which(df1$chrom == df2$chrom[i])] 
}

不工作！

来源

2012-04-09 user1079898

你在完成数据帧之间的比较时试图完成什么？对于您的工作流程，可能比您采用的方法更简单 - 例如，如果您只需要一个数据框架中的矢量，您是否需要许多此类矢量？一个新的数据框？什么是最终目标？这个背景对你所问的问题很重要。 – 2012-04-09 20:17:37

这是你想要的吗？

df2[df2$chrom == df1$chrom, ] 
# chrom start end 
# 1 chr1 15 75

根据您的意见，您可能还想尝试以下操作。

merge(df1, df2, by = 'chrom')

这将在两个帧（“表”）上执行数据库“连接”。结果是这样。

chrom start.x end.x start.y end.y 
1 chr1  10 100  15 75 
2 chr1  20 200  15 75 
3 chr1  30 300  15 75

这并不总是一种有效的方法来接收R，但它很方便。您可以使用参数控制“.x”内容（请参阅帮助页面：？合并）。如果您希望包含df2的所有字段，则可以添加“all = TRUE”参数设置进行合并。

正如我以前提到的那样，最好考虑整体方法。这不一定是处理数据的有效方式，因为现在您已在输入框架中输入了大量冗余。相反，用数据库术语来说，我们认为df2是一个“查找”表。 df1中的“chr1”引用与df1相关但与之不同的df2（外键）中的信息。正如上面的合并所显示的那样，如果重复df2的信息，我们可以在需要时简单地访问它。这是合并使得方便的地方。

来源

2012-04-09 20:16:19

是的，这正是我想要的格式。在具有6列的新数据帧中并排存在两个数据帧的匹配行将是很好的。实际上，我的最终目标要比两个数据框之间满足许多条件的比较要复杂得多。上述情况只是其中之一。 – user1079898 2012-04-09 20:18:50

您发送的声明非常有效。谢谢。我很难把头围绕在它周围......但它的工作原理！非常感谢你 – user1079898 2012-04-09 20:24:04

它首先很难得到（特别是如果你习惯于使用循环的另一种语言），但一旦你得到它，它非常简单。如果您有多个条件，请记住'％in％'和逻辑运算符'＆'和'|'是索引中的重要工具，这是Bryan显示的方法（而不是显式循环）。 – 2012-04-09 21:13:17

检索使用for循环的两个数据帧之间的匹配行

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