无法使用php执行命令行

Question

我试图运行本地BLAST的命令行。我已经下载了软件包并允许每个文件和文件夹的权限。但是我仍然无法在页面上显示它的输出。

echo shell_exec("/opt/lampp/htdocs/blasto/bin/blastp -query /opt/lampp/htdocs/blasto/result/INF2dWxh -db /opt/lampp/htdocs/blasto/db/*.faa -evalue 10 "); 

希望任何人都可以帮助我。

Answer 1

shell_exec只会返回标准输出。写入STDERR的任何错误消息都将丢失，除非您在命令末尾添加2>&1。这会将写入到STDERR（文件描述符＃2）的任何内容重定向到STDOUT（文件描述符＃1），该文件将由shell_exec返回并由echo显示。所以，试试这个...

echo shell_exec("/opt/lampp/htdocs/blasto/bin/blastp" 
    . " -query /opt/lampp/htdocs/blasto/result/INF2dWxh" 
    . " -db /opt/lampp/htdocs/blasto/db/*.faa" 
    . " -evalue 10" 
    . " 2>&1" 
);