2013-03-04 64 views
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我要去不喜欢EMBOSS软件包或史密斯 - watterman算法大序列的算法。所以我将需要一种方法来创建不同大小的矩阵,所以我的问题是哪个库为我提供了最好的性能,并且易于使用。矩阵处理大序列

P.S:我知道,OpenCV中,并加速可以处理矩阵,但我不知道是否有良好的做就可以操作。

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你可以用'的std ::矢量只是做<性病::矢量>'但是,如果你想使用libary随便挑一个,并用它去了,没必要把时间浪费在这是最好的。只要确保代码足够一般,以便您可以简单地更换库并使用其他库,这样您就可以在不同的库之间进行测试 – dchhetri 2013-03-04 20:36:11

回答

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如果“最佳性能”的要求,那么你必须看看NVIDIA CUDA或Intel MKL。像C++ boost uBLAS这样的库不关注性能,而是关注可用性。