为MPICH配置的valgrind：错误libmpi * .so文件使用

当运行Valgrind的检测MPI应用程序中的错误，我得到以下错误：为MPICH配置的valgrind：错误libmpi * .so文件使用

libmpi.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory

我发现了以下工作： Valgrind documentation（第4.9节.1）指出：“MPI被包装的函数被假定为在与soname匹配的ELF共享对象libmpi.so *中，至少对Open MPI和Quadrics MPI来说这是正确的，并且可以很容易地被改变需要。”

因此，因为我使用mpich2，它实际上应该使用libmpich.so.1.0。

这可以看出，在libmpiwrap.c：

#include "mpi.h" 

/* Where are API symbols? 
Open MPI  lib/libmpi.so, soname = libmpi.so.0 
Quadrics MPI lib/libmpi.so, soname = libmpi.so.0 
MPICH   libmpich.so.1.0, soname = libmpich.so.1.0 

A suitable soname to match with is therefore "libmpi*.so*".

我的问题是：在哪里以及如何配置呢？

来源

2012-05-05 mort

你是如何配置/安装Valgrind的？ MPICH2怎么样？IIRC它只是在你正确指定'--with-mpicc =/path/to/mpicc'到Valgrind的'configure'时起作用。还要确保您的MPICH2安装配置了“--enable-shared”。 –

根据valgrind文档，会自动检测mpi安装。我在哪里可以看到哪些mpi安装valgrind使用？配置只是告诉我，mpicc已被发现。 – mort

然后只要确保检测到正确的MPI安装。 '--with-mpicc ='选项只是帮助Valgrind找到正确的MPI安装。 –

我自己有这个问题。希望这可以指出你在正确的方向。不幸的是，MPI很难与valgrind和gdb一起工作。

选项1：找到合适的包装。

在Fedora/RHEL /（基于rpm的）系统上，您可以在valgrind-openmpi包中找到OpenMPI共享库。我找不到MPICH版本。我使用MVAPICH，所以这并没有帮助我。如果您找到MPICH/MVAPICH版本，请发表评论，以便我可以在此处添加它。

Valgrind OpenMPI

PBone示出了内容为具有共享对象中的libmpiwrapper。

选项2：从源代码构建库。（我为MVAPICH做了什么）

我采取了从源代码编译valgrind，然后复制共享库。我想保留valgrind的包管理器版本，所以我只匹配了源代码的版本，并使用默认的GCC来保证安全。你可以使用最新，最好的，但我怀疑你得到了很多。

在构建Valgrind时，您需要确保它找到正确的MPI安装。检查输出以验证正确的共享库和头文件。我有一个在系统上安装多个MPI的习惯，所以这是我学会了艰难的一步。花一些时间在autoconf/automake输出上。幸运的是，Valgrind的维护人员在保持构建非常简单方面做得很好，所以我没有遇到任何编译的主要问题。

源代码 http://valgrind.org/downloads/

一旦你拥有了它，关键则因为它们在文档中提到建立ENV变量。

其他注意事项 - https://wiki.mpich.org/mpich/index.php/Support_for_Debugging_Memory_Allocation - https://fs.hlrs.de/projects/marmot/publications/paralleldebugging-ppt.pdf

来源

2015-10-18 17:37:54 msmith81886