R如何创建单列表热图

我有一个工作解决方案，但我。我一直在使用mtcars数据集，并尝试用“disp”变量作为我可重现的例子进行着色。R如何创建单列表热图

> library(gplots) 
    > m<-cbind(mtcars[,3],mtcars[,3]) 
    > rownames(m)<-rownames(mtcars) 
    > heatmap.2(x=m,dendrogram="none",trace="none",Colv=FALSE,Rowv=FALSE,cellnote=cbind(rownames(m),rownames(m)),notecol="black")

我总能切出PDF的额外的行，在我的实际数据集与p值的表示替换（绘制比和p值是整个种群Fisher精确差），但这将在500个值的整个表上添加大量的处理（现在只是打印一个巨大的pdf）。我可以单独着色p值列并将它们粘贴在一起以获得最终数字，但假设这看起来很sl。。在任何步骤的建议表示赞赏。

来源

2014-10-07 sessmurda

注意heatmap.2（）不是一个函数从包'ggplot2'，但是从包装'gplots'！我用ggplot2发布了一个解决方案。 – ddiez 2014-10-08 04:41:41

与GGPLOT2 A液：

d=as.data.frame.table(m[,1,drop=FALSE]) 
ggplot(d,aes(x=Var2,y=Var1,fill=Freq)) + geom_tile()

来源

2014-10-08 04:43:34 ddiez

R如何创建单列表热图

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