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我正在尝试在r中创建一个抗肺炎克雷伯菌属为'Resistant','Susceptible'或'Intermediate'部分的抗生素矩阵。然而,功能我目前使用:为什么我的函数在创建num(0)和NULL输出?
Klebsiella.pneumoniae.rs.mat1 <-
tapply(Klebsiella.pneumoniae.rs$resistant_phenotype, INDEX =
list(Klebsiella.pneumoniae.rs$antibiotic), FUN = function(x)
{
fracR = sum(x=='Resistant')/(nrow(x))
fracS = sum(x=='Susceptible')/(nrow(x))
fracI = sum(x=='Intermediate')/(nrow(x))
return(c(fracR, fracS, fracI))
})
的输出:
amikacin Numeric,0
ampicillin Numeric,0
ampicillin/sulbactam Numeric,0
aztreonam Numeric,0
cefazolin Numeric,0
cefepime Numeric,0
cefotaxime Numeric,0
cefoxitin Numeric,0
ceftazidime Numeric,0
ceftriaxone Numeric,0
cefuroxime NULL
cephalothin Numeric,0
....
任何想法是怎么回事? (原始数据是一列抗生素名称,以及一列耐药表型和其他一些列)
谢谢!
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