使用ggplot在R中添加错误栏

我想在R中绘制一个情节，用LWP绘制两个分类变量（treat）。使用ggplot在R中添加错误栏

我想改变点的颜色（填充）以与变量rootpatH（每次处理中的一个点）相对应。

我也想补充一个符号，如果差异显著或不..

Plants.means<-aggregate(Plants[10:44],Plants[c(6,9)],mean,na.rm=TRUE) 

SE<-function(x)(sd(x,na.rm=TRUE)/ (length(x)-sum(is.na(x)))^0.5) 


ggplot(Plants.means, aes(x=Treat, y=Yield, group=1)) + 
geom_errorbar(width=.1, aes(ymin=Yield-SE(Plants.means$Yield), ymax=Yield+SE(Plants.means$Yield))) + 
geom_point(shape=21, size=3, fill="white") + 
ylim(0,1750)

我也想改变误差条代表95％CI，而不是SE。

款待是分类 ROOTPATH是分类 LWP_meas2是连续

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来源

2013-02-02 user1977802

'SE'是一个函数，而不是一个数值;大概你想'SE（某事）'... –

如何在每组点之后添加文本“ns”和“*”来表示它们是否显着不同？ – user1977802

error <- function(x)(qt(0.975,df=length(x)-1)*sd(x)/sqrt(length(x))) 

ggplot(Plants.means,aes(x=Treat, y=Yield, colour=rootpatH, group=rootpatH)) + 
geom_errorbar(aes(ymin=Yield-error(Plants.means$Yield),ymax=Yield+error(Plants.means$Yield)), colour="black",width=.1, position=pd) + 
geom_point(position=pd, size=4)

来源

2013-02-03 03:44:37 user1977802

正如本说，你可能想是这样的（必要没有测试，因为没有数据提供：

with(Plants.means, 
       errbar(x =Treat, y = LWP_Meas2, 
           yplus = LWP_Meas2 + SE(LWP_Meas2), 
           yminus = LWP_Meas2 - SE(LWP_Meas2), 
     add=T,na.rm=TRUE, col=c("blue", "hotpink")) 
    )

来源

2013-02-03 01:19:46

使用ggplot在R中添加错误栏

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