如何在Debian Linux系统上将h5py（+ numpy + libhdf5 + ...）安装为非root用户

Question

我需要在Debian Linux系统上安装h5py Python模块及其所有缺失的依赖项。这个任务很复杂，如下所示：

1. 我没有这个系统的超级用户权限（没有sudo，没有root密码等等）。
2. 我使用的其他代码需要Python 2.7版本，这不是在此系统中安装的默认版本（尽管Python 2.7在/opt/python-2.7.1下可用）。

理想的解决方案是使我能够使用python-h5py Debian软件包（wheezy release）中的依赖关系信息编排安装所有缺少的h5py先决条件。有没有办法做到这一点？如果是这样的话，我如何指定/opt/python-2.7.1下的Python版本作为使用的版本？

关于如何最好地做到这一点的任何建议，将不胜感激！

Answer 1

这应该可以使用virtualenv。您可以创建这样一个的virtualenv（在命令行）：

virtualenv -p /opt/python-2.7.1 mypythonenv 

最后一位是一个新的文件夹中的环境中去的名称

然后：

cd mypythonenv 
source bin/activate 

然后你可以安装你想要的任何Python模块，并且它们将被安装在virtualenv中，而不需要任何超级用户权限。据我所知，你不能在那里使用.deb包，但是你可以在它里面使用Python安装程序，比如pip或者easy_install。

Answer 2

这是矫枉过正而不是免费的解决方案，但您可以安装Enthought Python Distribution。 HDF5，h5py和（我最喜欢的）pytables都是免费的。建筑物的numpy是一种痛苦，让别人为你做包装通常更容易。它是免费的学术用法。