包的错误运行在命令行

Question

R代码里面，当我有一些代码，我运行，其中包括这一部分：

if (!require("yaml")) { 
    install.packages("yaml") 
    library("yaml") 
} 

当我在它rstudio运行，一切都无缝地运行，并没有错误。然而，当我尝试在命令行中运行我的代码，我得到这个错误：

$ Rscript.exe file.R 
Loading required package: yaml 
Installing package(s) into ‘/usr/lib/R/site-library’ 
(as ‘lib’ is unspecified) 
Error in contrib.url(repos, type) : 
    trying to use CRAN without setting a mirror 
Calls: install.packages -> grep -> contrib.url 
In addition: Warning message: 
In library(package, lib.loc = lib.loc, character.only = TRUE, logical.return = TRUE, : 
    there is no package called ‘yaml’ 
Execution halted 

Answer 1

RStudio设置一个默认存储库，当你从内RStudio调用install.packages。当您通过命令行运行脚本时，必须告诉R使用哪个存储库（或设置全局默认存储库）。

您可以通过告诉R使用您喜欢的存储库来轻松解决此问题。

例如，如果要使用RStudio的包存储库，请在install.packages调用中设置repos="http://cran.rstudio.com/"。

if (!require("yaml")) { 
    install.packages("yaml", repos="http://cran.rstudio.com/") 
    library("yaml") 
} 

这应该工作！