2012-06-05 176 views
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对于小于1e-10的数字,我有一个y缩放的问题:它们全都出现在同一条水平线上。小数字的Y轴缩放问题

这里是一个重复的例子:

file <- structure(list(I = c(-7.254574e-11, -5.649333e-11, -5.015416e-11, 
-4.228137e-11, -3.287486e-11, -2.714915e-11, -2.203692e-11, -1.784489e-11, 
-1.150574e-11, -1.058553e-11, -6.189018e-12, -3.735149e-12, -2.303724e-12, 
6.610914e-13, 1.274374e-12, -3.610768e-13, 5.465134e-12, 6.691699e-12, 
8.020478e-12, 1.139353e-11, 1.537988e-11, 1.926399e-11, 2.130825e-11, 
2.45791e-11, 3.204071e-11, 3.582262e-11, 4.287535e-11, 4.624839e-11, 
5.16657e-11, 6.035387e-11), V = c(-2, -1.867, -1.733, -1.6, -1.467, 
-1.333, -1.2, -1.067, -0.933, -0.8, -0.667, -0.533, -0.4, -0.267, 
-0.133, 0, 0.133, 0.267, 0.4, 0.533, 0.667, 0.8, 0.933, 1.067, 
1.2, 1.333, 1.467, 1.6, 1.733, 1.867)), .Names = c("I", "V"), class = "data.frame", row.names = c(NA, 
-30L)) 

plot(file$V,file$I) 

gg <- ggplot(file,aes(x = V,y=I)) 
print(gg + geom_point()) 

正如你所看到的,使用基本绘图功能点被同时使用GGPLOT2它们显示在一个水平线上正确显示。

2011年5月,我在邮件列表上看到了一个类似的帖子,哈德利回答说它与ggplot2的开发版一起工作。但是,使用下面描述的R版本,我仍然得到错误。

> sessionInfo() 
R version 2.15.0 (2012-03-30) 
Platform: i686-pc-linux-gnu (32-bit) 

locale: 
[1] LC_CTYPE=fr_FR.UTF-8  LC_NUMERIC=C    LC_TIME=fr_FR.UTF-8  
[4] LC_COLLATE=fr_FR.UTF-8  LC_MONETARY=fr_FR.UTF-8 LC_MESSAGES=fr_FR.UTF-8 
[7] LC_PAPER=C     LC_NAME=C     LC_ADDRESS=C    
[10] LC_TELEPHONE=C    LC_MEASUREMENT=fr_FR.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C  

attached base packages: 
[1] stats  graphics grDevices utils  datasets methods base  

other attached packages: 
[1] tikzDevice_0.6.2 filehash_2.2-1 scales_0.2.0  plyr_1.7.1  reshape2_1.2.1 
[6] ggplot2_0.9.0 

loaded via a namespace (and not attached): 
[1] colorspace_1.1-1 dichromat_1.2-4 digest_0.5.2  grid_2.15.0  MASS_7.3-18  
[6] memoise_0.1  munsell_0.3  proto_0.3-9.2  RColorBrewer_1.0-5 stringr_0.6  
[11] tools_2.15.0 

任何人都有线索?

预先感谢您! Thibaud Ruelle

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+1快速测试证实了我的系统上的这种行为(ggplot2 0.9.1)。也许有一个逆转,或? –

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@BenBolker考虑到前面的问题与[this](http://stackoverflow.com/q/10808056/324364)的连接,我在Brian的聊天记录中询问了这件事。 – joran

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@joran是的,似乎这两个职位可以合并。对不起,我的研究没有发现它。 –

回答

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由于Brian Diggs对a related post that @joran pointed to above发表了评论,该问题由功能scales::zero_range()引起。它使用all.equal()来测试最小和最大的y值是否在tolerance = .Machine$double.eps^0.5 = 1.490116e-08之内;如果是的话,数据将以您的示例中使用的“零标度”绘制。

作为临时修复,您可以使用fixInNamespace()删除zero_range()的违规位。

library(scales) ## (The scales package needs to be on your search path) 
fixInNamespace("zero_range", pos="package:scales") 

在由fixInNamespace()推出的编辑器,取代zero_range()这个定义:

function (x) 
{ 
    length(x) == 1 || isTRUE(all.equal(x[1] - x[2], 0)) 
} 

与这一个(确保保存编辑后的版本):

function (x) 
{ 
    length(x) == 1 
} 

你的代码提供然后运行就好:

enter image description here

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我想你也可以在'all.equal'中调整'tolerance'参数。 – joran

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@joran - 任何想法什么会更好的价值?我不知道Hadley试图用这些代码来防止病态是什么,所以不知道有多低可以安全地去...(所以当然我去了,一起去除了所有的保护;) –

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那么,'' zero_range'通常会传递一个带有最小/最大值的向量,所以您希望在这里检查_some_,看它们是否相同。也许只是检查'x [1] == x [2]'?我觉得在这里有浮点边缘案例,我不明白。 – joran