通行证进入名单中的R

我试图通过所有的数字在数据帧的列wilcox.test在R.通行证进入名单中的R

使用wilcox.test(·)如果我通过c(1,2,3)只是正常进行分析，但我想将预先存在的数据库中的列传递给该函数，而无需完全输入。（有〜200万行）

跑过列给出了错误：'x' must be numeric. （可以理解的是这样）

样本数据：使用

AA  AC  AD   AE   AF 
0.6047619 NA -1.0000000 1.0059524 -1.000000 
-0.2348790 NA 0.5812500 0.1294643 -1.000000 
0.9523810 -1 -1.0000000 -1.0000000 -1.000000

声明：

{print(wilcox.test(list, y = NULL, correct = TRUE, mu = 0, exact = NULL))}

错误消息：

Error in wilcox.test.default(list, y = NULL, correct = TRUE, mu = 0, exact = NULL) : 
    'x' must be numeric

列表是数据框的一列。从AA到0.9523810。

来源

2013-06-04 user2211355

请包括样本数据和可重复的代码：http://stackoverflow.com/questions/5963269/how-to-make-a-great-r-reproducible-example – Thomas

什么是'list'？你的数据框？ – Thomas

要在名为df数据帧指定给定列，可以使用下列之一：

df[1, ]  # by number: first column 
df["x1", ] # by name: column that is named "x1" 
df$x1  # also by name

因此，在这种情况下，你可以使用（如果你想列名为“AA”）

wilcox.test(df$AA, y=NULL, correct=TRUE, mu=0, exact=NULL)

来源

2013-06-04 14:27:01

列名称的工作。谢谢！ :) – user2211355

如果list是你的数据帧，你可以用下面的获得为每列结果：

apply(list,2,wilcox.test, y = NULL, correct = TRUE, mu = 0, exact = NULL)

你得到一个错误，因为你的一列是不是一个数值变量。

来源

2013-06-04 14:21:03 Thomas

我尝试使用名称（列表）删除第一列。它没有改变任何东西，我仍然收到相同的错误信息。 – user2211355

数据框数字中的所有列都是？看起来不是。找到那些不是数字的，并删除它们，然后这将工作。 – Thomas

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