2013-04-25 57 views
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我的一些python脚本使用rpy2作为R的接口,它与以前的Enthought EPD python完美配合。安装Enthought Canopy后安装python模块“rpy2”

我最近安装了Enthought的Canopy Python。 的Python现在不再发现rpy2模块,当我尝试重新安装它,我得到以下错误:

$ easy_install rpy2 

[...] 

Processing rpy2-2.3.5.tar.gz 
Writing /var/folders/9n/qk8wf11d205b0lrr57wyg7k80000gp/T/easy_install-HIclIh/rpy2-2.3.5/setup.cfg 
Running rpy2-2.3.5/setup.py -q bdist_egg --dist-dir /var/folders/9n/qk8wf11d205b0lrr57wyg7k80000gp/T/easy_install-HIclIh/rpy2-2.3.5/egg-dist-tmp-A3O60G 
"/Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R" CMD config --ldflags 
/Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/config: line 142: make: command not found 
/Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/config: line 143: make: command not found 
R was not built as a library 
Invalid substring 

in string 

error: Setup script exited with Problem while running `"/Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R" CMD config --ldflags` 

回答

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你的错误意味着r为不--enable-R-SHLIB或内置安装程序很难找到R.你是否也在这个过程中的某个地方升级/重新安装/重建R?在终端什么是以下命令的输出:

echo $R_HOME 

ls $R_HOME/lib 

大概是第一个展示/Library/Frameworks/R.framework/Resources相匹配的RPY安装正在哪里,但第二个版本中有libR.dylib吗?

如果不是,你有没有尝试重新安装R?

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感谢您的回答!事实证明,我不得不重建R,为此我不得不下载Xcode命令行工具。以下是解决问题的方法:1。在R-3.0.0文件夹下载的Xcode(4.6.2)的最新版本 2.在Xcode首选项>下载>安装的命令行工具 3.下载R 4的最新版本:的./configure - enable-R-shlib 5. easy_install rpy2 – Martin 2013-04-25 16:07:19