忽略readr中的尾部分隔符:: read_csv

Question

当我使用readr::read_csv读取包含尾随分隔符的CSV文件时，我收到一条警告，指出缺少一个列名称。下面是一个简短示例CSV文件的内容以重现此操作警告（存储下面的片段在名为example.csv文件）：

A,B,C, 
2,1,1, 
14,22,5, 
9,-4,8, 
17,9,-3, 

注意后面的逗号在每一行的末尾。现在，如果我打开这个文件，

read_csv("example.csv") 

我得到以下警告：

Missing column names filled in: 'X4' 

即使我想与

read_csv("example.csv", col_types=cols_only(A=col_integer(), 
              B=col_integer(), 
              C=col_integer())) 

我仍然得到显式地加载只有3列警告信息。

这是预期的行为还是有一些方法可以告诉read_csv它应该忽略除指定的列之外的所有列？或者还有另一种方法来清理这个（显然格式不正确的）CSV，以便尾随分隔符被删除/忽略？

Answer 1

我不认为你可以。从我可以在文档中看到，cols_only()是您已经加载中的R对象

然而，从data.table库fread()功能可让您选择具体列名的文件中读取：

DT <- fread("filename.csv", select = c("colA","colB"))

Answer 2

下面是错误消息的另一个示例。

> read_csv("1,2,3\n4,5,6", col_names = c("x", "y")) 
Warning: 2 parsing failures. 
row # A tibble: 2 x 5 col  row col expected actual   file expected <int> <chr>  <chr>  <chr>  <chr> actual 1  1 <NA> 2 columns 3 columns literal data file 2  2 <NA> 2 columns 3 columns literal data 

# A tibble: 2 x 2 
     x  y 
    <int> <int> 
1  1  2 
2  4  5 

这里是修复/破解。另请参阅此SOF链接。 Suppress reader parse problems in r

> suppressWarnings(read_csv("1,2,3\n4,5,6", col_names = c("x", "y"))) 
# A tibble: 2 x 2 
     x  y 
    <int> <int> 
1  1  2 
2  4  5