在travis的testthat测试中使用load（）加载.RData文件中的数据

我正在使用testthat包与我正在开发的R包一起运行单元测试。我遇到了一个奇怪的情况，我无法弄清楚我做错了什么。我试图加载一些测试数据（存储在数据框中）和一些预先计算的答案（再次存储在数据框中）来测试一些函数并比较结果。我已经将两组数据都保存为.Rdata文件（在tests/testthat /目录中），并且在我运行测试前加载它们。load(file.path('filename.RData'))在travis的testthat测试中使用load（）加载.RData文件中的数据

当我在我的计算机上运行测试时，测试运行良好。但是，当他们在特拉维斯跑，我得到的错误：

> test_check("mocapGrip") 
    Error in readChar(con, 5L, useBytes = TRUE) : cannot open the connection 
    Calls: test_check ... force -> source_file -> eval -> eval -> load -> readChar 
    In addition: Warning message: 
    In readChar(con, 5L, useBytes = TRUE) : 
    cannot open compressed file 'extractedMarkerData.Rdata', probable reason 'No such file or directory'

我肯定失去了一些东西很简单，但我已经尝试了所有的明显的事情（从目录等开始指定相对路径）有没有人有关于如何让Travis能够加载这些文件的任何想法？

这里是违规的内容testthat文件：

library(mocapGrip) 
context("distance calculationss") 

load(file.path('extractedMarkerData.Rdata')) # markerDataHead 
load(file.path('dist57.RData')) # dist57head 
load(file.path('meanData.Rdata')) # meanDataHead 

test_that("calculateDistances returns the correct distances", { 
    expect_equal(mocapGrip:::calculateDistances(markerDataHead, c(5,7)), dist57head) 
}) 

test_that("meanOnAxis returns the correct distances", { 
    expect_equal(mocapGrip:::meanOnAxis(markerDataHead, c(0, 1, 2, 3, 4), axis ="Y"), meanDataHead) 
})

来源

2016-04-26 Jon Keane

用'getwd（）'检查你的工作目录，并确保你正在加载的'.Rdata'文件在目录中（使用'list.files（）'来检查）。另外，尝试函数加载为'load（file ='extractedMarkerData.Rdata'）' –

我已经尝试添加这些来诊断travis的检查，并且看起来这些文件*在工作目录中是*，但对于某些原因R无法访问它们（再次，当我在我的计算机上运行测试时，这种方式工作正常，但当它们在特拉维斯上运行时不起作用）。这里是[travis日志]（https://travis-ci.org/jonkeane/mocapGrip/builds/125995784＃L1567-L1580） –

而且它的确是一些简单的：不区分大小写OS X正默默地无视我有错的情况下（.Rdata与.RData）和Ubuntu的系统运行travis是区分大小写的，所以当搜索提取的MarkerData.RData时，找到提取的MarkerData.Rdata不起作用（因为它不应该工作，因为Ubuntu是区分大小写的）。修好了，现在一切都很好。

来源

2016-04-27 20:40:12

在travis的testthat测试中使用load（）加载.RData文件中的数据

回答

相关问题