找到一个矩阵3米最短距离

Question

我按下面的网站的对角距离矩阵

 head(distancematrix) 
      15001  15002 15003 15004  15005  15008  
15001 0.0000 252.9474 390.4716 858.7412 1082.2168 1262.6803 
15002 252.9474 0.0000 164.8057 608.5672 834.7632 1033.4702 
15003 390.4716 164.8057 0.0000 477.9417 755.8448 990.6740 
15004 858.7412 608.5672 477.9417 0.0000 370.3795 668.1066 
15005 1082.2168 834.7632 755.8448 370.3795 0.0000 303.5589 
15008 1262.6803 1033.4702 990.6740 668.1066 303.5589 0.0000 

我希望能够得到每个站点的数据帧中的行与沿距离它最近的3个站点。

site s1  s2  s3 
15001 252.9474 390.4716 858.7412 
15002 164.8057 608.5672 834.7632 

Answer 1

你可以尝试使用apply。在这种情况下，我们正在对每一行进行排序，并将第二到第四个值排序 - 最低排除0。第2行的输出不符合您的示例，因为您错过了252.9474点：

t(apply(dat, 1, function(x){sort(x)[2:4]})) 

      [,1]  [,2]  [,3] 
15001 252.9474 390.4716 858.7412 
15002 164.8057 252.9474 608.5672 
15003 164.8057 390.4716 477.9417 
15004 370.3795 477.9417 608.5672 
15005 303.5589 370.3795 755.8448 
15008 303.5589 668.1066 990.6740