运行相同的代码。你为什么编辑by=3
?您想创建idx = 1, 3, 5 ...
。 by=3
,将创建1, 4, 7...
。您的数据,只要它是在格式Time, data, Time, data, Time, data, ..., ...
,您可以使用相同的代码
require(IRanges)
# by equals 2 because we want to get the `Time` column index every time
idx <- seq(1, ncol(data), by=2)
# idx is now 1, 3, 5. It will be passed one value at a time to `i`.
# that is, `i` will take values 1 first, then 3 and then 5 and each time
# the code within is executed.
o <- lapply(idx, function(i) {
ir1 <- IRanges(start=seq(0, max(data[[i]]), by=401), width=401)
ir2 <- IRanges(start=data[[i]], width=1)
t <- findOverlaps(ir1, ir2)
d <- data.frame(mean=tapply(data[[i+1]], queryHits(t), mean))
cbind(as.data.frame(ir1), d)
})
让我对这样的数据:
# > o
# [[1]]
# start end width mean
# 1 0 400 401 1.05
#
# [[2]]
# start end width mean
# 1 0 400 401 1.1
#
# [[3]]
# start end width mean
# 1 0 400 401 1.383333
你有没有运行** **完全相同的代码我用三个样本写了这些数据?它应该适用于任何数量的标本。这就是为什么我们采用其他所有列并使用'lapply'运行。这对我来说可以。也许你应该向我们展示你想要的输出......? – Arun 2013-02-22 07:14:13
如果他们回答你的问题,请接受答案。 – Arun 2013-02-22 07:19:22
也在这里:请阅读[FAQ](http://stackoverflow.com/faq)如何提出一个问题:给它一个有意义的标题是一开始。 – 2013-02-25 12:38:15