2013-06-05 34 views
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我正在努力将nexted xml数据移动到分层数据框架中。由于SO的帮助,我能够从xml中获取所有数据。但是,现在,我正在努力清理在提取输出之前提取并形成的数据,因为我将这样做数千次。在python中使用lxml和xpath通过xml属性进行动态搜索

更新:这是我事实上想要的。我似乎无法动态获取Timevaluechannel。频道名称将随每个文件而改变。

channel = txt1[0](此文件,txt1[0]="blah")通过时channel = txt1[8](这个文件,txt1[8]="lir"

channel  Time     value 
0  blah  2013-05-01 00:00:00 258 
1  blah  2013-05-01 00:01:00 259 
... 
n-2 lir  2013-05-01 23:57:00 58 
n-1 lir  2013-05-01 23:58:00 37 
n  lir  2013-05-01 23:59:00 32 

这里是我的xml文件是如何获取和结构化:

import requests 
from lxml import etree, objectify 
r = requests.get('https://api.stuff.us/place/getData? security_key=key&period=minutes&startTime=2013-05-01T00:00&endTime=2013-05-01T23:59&sort=channel') #edited for privacy 
root = etree.fromstring(r.text) 
xml_new = etree.tostring(root, pretty_print=True) 
print xml_new[300:900] #gives xml output to show structure 
<startTime>2013-05-01 00:00:00</startTime> 
<endTime>2013-05-01 23:59:00</endTime> 
<summaryPeriod>minutes</summaryPeriod> 
<data> 
    <channel channel="97925" name="blah"> 
    <Time Time="2013-05-01 00:00:00"> 
     <value>258</value> 
    </Time> 
    <Time Time="2013-05-01 00:01:00"> 
     <value>259</value> 
    </Time> 
    <Time Time="2013-05-01 00:02:00"> 
     <value>258</value> 
    </Time> 
    <Time Time="2013-05-01 00:03:00"> 
     <value>257</value> 
    </Time> 

昨天,我在这里问了这个问题,并解决了将数据帧中的值和timevalue合并成一个数据帧的问题:Parsing xml to pandas data frame throws memory error

dTime=[] 
dvalue=[] 
for df in root.xpath('//channel/Time'): 
    ## Iterate over attributes of Time but Time only has one attrib [@Time] 
    for attrib in df.attrib: 
    dTime.append(df.attrib[attrib]) 
    ## value is a child of time, and iterate 
    subfields = df.getchildren() 
    for subfield in subfields: 
    dvalue.append(subfield.text) 
pef=DataFrame({'Time':dTime,'values':dvalue}) 

pef 

&ltclass 'pandas.core.frame.DataFrame'&gt 
Int64Index: 12960 entries, 0 to 12959 
Data columns (total 2 columns): 
Time  12960 non-null values 
value 12960 non-null values 
dtypes: object(2) 

pef[:5] 

    Time     value 
0 2013-05-01 00:00:00 258 
1 2013-05-01 00:01:00 259 
2 2013-05-01 00:02:00 258 
3 2013-05-01 00:03:00 257 
4 2013-05-01 00:04:00 257 

现在,我正在给这个数据输出为每个信道的(结构是channel - >Time - >value)分开,这样我可以插入信道作为数据集的一列。

因此,我决定动态获取通道名称,并搜索数据。对于此文件,有九个独立的有效通道名称,但对于所有文件(数字或名称)不同。

txt1 = root.xpath('//channel/@name') #this prints all channel names! 
len(txt1) 
Out[67]: 9 
print txt1 
['blah', 'b', 'c', 'd', 'vd', 'ef', 'fg', 'kc', 'lir'] 

我想我可以动态地获取数据(使用较早的解决方案,但增加@name=txt1[0]),并最终做了for i = 0 to len(txt1), ...要经过所有的人。但是,我得到一个空的数据帧:

dTime=[] 
dchannel = txt1[0] # can hardcode, but need to be able to get all 
dvalue=[] 
for df in root.xpath('//channel[@name=txt1[0]]/Time'): 
    #CODE NEEDED: to get dchannel to dynamically = channel[@name] 
    ## Iterate over attributes of time for specific channel 
    for attrib in df.attrib: 
    dTime.append(df.attrib[attrib]) 
    ## value is a child of time, and iterate 
    subfields = df.getchildren() 
    for subfield in subfields: 
    dvalue.append(subfield.text) 
perf=DataFrame({'Channel': dchannel,'Time':dTime,'values':dvalue}) 

perf 

Int64Index([], dtype=int64) 
Empty DataFrame 

如果我硬编码所需的属性,就像for df in root.xpath('/*/*/*/channel[@name="blah"]/Time'):它将打印一个属性,但我不能让它工作参考txt1[]

我试图参照{0}..., txt1[]但随后吐出来了D信道属性的元组(因为它是让所有txt1中,而不是获取txt1中属性名称是时间节点的父节点。

我查看了XPath文档,并且我已经通过了lxml教程,并且我无法弄清楚为什么我的动态搜索不起作用。我是否需要回退到.findall()?如何使用此动态搜索来获取每个数据值在txt1

有可能是一个更pythonic的方法来解决这个问题,如设置一个函数,获取attr ibute [@name]的父母,属性[@Time]的孩子,然后孙子的文字value,但我还没有想出如何做到这一点呢。

回答

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好的,我解决了这个问题 - 但解决方案仍然很难看。

我很高兴能想出来得到我想要的输出。如果有人有一个更清洁的方法,我会很乐意看到它。谢谢。

dTime=[] 
dchannel = [] 
dvalue=[] 
for df in root.xpath('//channel/Time'): 
    dchannel.append(df.getparent().attrib['name']) 
    ## Iterate over attributes of time for specific channel 
    for attrib in df.attrib: 
    dTime.append(df.attrib[attrib]) 
    ## value is a child of time, and iterate 
    subfields = df.getchildren() 
    for subfield in subfields: 
    dvalue.append(subfield.text) 
perf=DataFrame({'Channel': dchannel,'Time':dTime,'values':dvalue}) 

perf[:2] 
    Channel  Time     value 
0 blah  2013-05-01 00:00:00 258 
1 blah  2013-05-01 00:01:00 259 
2 blah  2013-05-01 00:02:00 258 

perf[12957:12960] 
    Channel  Time     value 
12957 lir  2013-05-01 00:00:00 67 
12958 lir  2013-05-01 00:01:00 67 
12959 lir  2013-05-01 00:02:00 66 

YAY