用awk打印三列，然后打印三列

Question

我想从一个更大的文件中按列分割创建大量文件。例如，我的大文件的标题是这样的：

Name Chr Position SNP1A SNP1B SNP1C SNP2A SNP2B SNP2C SNP3A SNP3B SNP3C

，我想创建这些文件：

Name Chr Position SNP1A SNP1B SNP1C

Name Chr Position SNP2A SNP2B SNP2C

Name Chr Position SNP3A SNP3B SNP3C

我一直试图使用awk，但我有点新手无线日，所以我的命令当前读取：

for ((i=1; i<=440;i++)); do awk -f printindivs.awk inputfile done 

其中printindivs.awk是： {print $1 $2 $3 $((3*$i)+1) $((3*$i)+2) $((3*$i)+3))}

我得到的输出表明，我试图让三个组的方法是错误的：如何我可以这样做吗？

感谢

Answer 1

为此，您可以轻松地将只是一个简单的脚本awk：

$ awk '{for(i=4;i<=NF;i+=3)print $1,$2,$3,$i,$(i+1),$(i+2) > ("out"++j)}' file 

输出文件将在out[1..n]：

$ cat out1 
Name Chr Position SNP1A SNP1B SNP1C 

$ cat out2 
Name Chr Position SNP2A SNP2B SNP2C 

$ cat out3 
Name Chr Position SNP3A SNP3B SNP3C