2012-08-25 41 views
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我有一个程序非常基本,只有函数和变量,并执行一些计算。构建部分很好。只有cout,增加,等等非常基本的东西。从Linux到Windows的C/C++代码非常慢

在Linux,程序运行在Eclipse CDT的细,(在大约3-4秒中运行)

当程序上的Visual Studio 2010 C++视窗7中运行,把163秒 当程序运行在Windows 7 eclipse C++与MinGW,很多

这里发生了什么?!!?!

编辑:用于不能称之为C++,它只是很多的这里C函数,这里是从主()

foutput1 = fopen(FILENAME1, "w"); 
foutput2 = fopen(FILENAME2, "w"); 
solveSystem(); 
OutputStepToFile(); 
iter++; 
do 
{ 
    temporalExternalChange(tim); 
    do 
    { 
     solveSystem(); 
     iter++; 
    } while (iter<T_FOUT); 
    iter = 0; 
    OutputStepToFile(); 
    tim+=dt*T_FOUT; 
    if (fmod(tim,T_PRINT)<=0.0){cout << "\nt=" << tim << "ms";}; 
} while(tim<T_TOTAL); 

SolveSystem(代码)是以下的(局部的),其只是函数做计算一些变量:

 void solveSystem() 
     { 

fsGCcGMPformation();  // !cGMP formation 
falp1AdAct_IP3form();  // !Norepinephrine receptor 
fIVoCC();     // !Voltage dependent calcium current I_CaL 
fIKv();      // !Delayed rectifier current I_K 
fIBKCa();     // !Calcium-activated potassium 
    ... 
    ... 
    ... 
fVoltageChange(); 
performODEstep(); 
} 

OutputStepToFile()函数是简单地用C风格的文件输出

void OutputStepToFile() 
    { 
    fprintf(foutput1,"%g %g %g %g %g %g %g %g ",V_m, tim, Ca_i, Na_i, K_i, Cl_i, Ca_u, Ca_r);              // 1 
    fprintf(foutput1,"%g %g %g %g %g %g %g ",d_L, f_L, BKCa_a, KvD_a, KvD_i_slow, KvD_i_fast, KCNQ_a);  // 8 
    fprintf(foutput1,"%g %g %g %g ",P_SOC, R_01, R_10, R_11); // 15 
    fprintf(foutput1,"%g %g %g %g %g %g %g %g %g\n", h_IP3, RS_G, RS_PG, G, IP3, PIP2, DAG, V_cGMP, cGMP); // 22 

    // Store Ca,K,Cl,Na ion channels 
    fprintf(foutput2,"%g %g %g %g %g %g %g %g %g ", I_CaL, I_CaT, I_BKCa, I_KvD, I_KCNQ, I_K2P, I_Kir, I_KATP, I_CaCC); 
    // Store ROCs/SOCs 
    fprintf(foutput2,"%g %g %g %g %g %g %g ", INa_NSC, IK_NSC, ICa_NSC, I_NSC, I_SOCNa, I_SOCCa, I_SOC); 
    // store SR dynamic currents, co-transporters, pumps and exchangers 
    fprintf(foutput2,"%g %g %g %g %g %g %g %g ", I_up, I_tr, I_rel, I_IP3, I_PMCA, I_NaK, I_NCX, I_NaKCl_Cl); 
    fprintf(foutput2,"%g %g %g %g %g %g\n",  I_stim, V_cGMPbar, I_Catotm, I_Natotm, I_Cltotm, I_Ktotm); 
    } 
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没有看到用于编译它的代码和编译器开关,我们就像你一样无知。 –

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您是否尝试过使用Win7 MinGW进行任何调试?只是为了检查,没有图书馆被包括或链接? – MartyE

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@Insilico对不起,我已经包含了一些代码,但不知道它是否有帮助。正如你所看到的,他们非常简单。没有疯狂的文件输出屏幕或文件,因为我从代码中删除这些,程序仍然运行缓慢。我已经尝试了调试和发布。 “编译器开关用于编译它”是什么意思? – woosah

回答

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唯一的可靠方式找出你的程序在哪里花费所有的时间是简介它。这会告诉你每个方法/功能花费的时间,你应该能够追踪延迟。如果出于某种原因无法使用分析器,则可以尝试在代码的关键阶段插入几个定时调用来隔离问题的位置。

这就是说,我的猜测是在你程序的I/O部分(cout,printf ...)。计算应该在两种体系结构上编译为类似的代码,除非您使用外部库,否则它们不应受移植进程的影响。另一方面,I/O调用可能会受到标准库的差异以及每个OS如何处理缓冲和I/O的影响。可以想象,也可能有一些库函数在Windows上不能很好地实现。

一个重要的信息就是你的程序在这160多秒内的表现如何。它是100%燃烧CPU还是怠速等待发生什么?

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在solveSystem()内部调用的函数之一可能因某种原因而表现不同。 我建议,你首先注释掉solveSystem()中的所有函数。检查它是否仍然在VC++上花费超过160秒。依次启用solveSystem()中的函数。