不能够在Windows上运行

我努力地在Windows上运行bash脚本，但我得到的消息bash脚本“对不起，只是Linux和MacOS的支持。”不能够在Windows上运行

我已经为了能够在Windows平台上运行sh脚本安装了Cygwin和碰杯但它仍然是无济于事的。

这里是我的bash脚本，

#!/bin/bash 
for ((j=0;j<10;j++)); do 
    rtg map -i sample_NA19240/SRR003988 -t hg19 -o map_sample_NA19240/SRR003988- $j --start-read=$[j*1000000] --end-read=$[(j+1)*1000000] 
done

来源

2015-12-20 Adnan Haider

它在你正在使用的程序， “RTG”：

# Pre-flight safety-belts 
if [ "$(uname -s)" != "Linux" ] && [ "$(uname -s)" != "Darwin" ]; then 
    # If you comment this check out you are on your own :-) 
    echo "Sorry, only Linux and MacOS are supported." 
    exit 1

你可以试试 “意见”，就是去掉勾选在文件安装程序/ rtg中。如果它有效，你很幸运。否则使用虚拟机或询问rtg作者。

来源

2015-12-20 19:29:02 smarquis

+1用于诊断的问题;还有另外一种选择，但是：该实用程序是在一个（64位只）Windows版本太 - 从[这里]下载（https://github.com/RealTimeGenomics/rtg-tools/releases）。 Cygwin能够从Bash脚本调用Windows CLI。 – mklement0

感谢smarquis和mklement！其实我使用RTG的Windows版本，但它仍然给我同样的信息。也许该程序未配置为使用该bash脚本在Windows上运行。 –

没错，在Windows下你需要调用提供rtg.bat，而不是RTG bash脚本。 – smarquis

不能够在Windows上运行

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