doparallel

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    多边并行嵌套在循环中的循环工作，但逻辑上没有意义？

    我有一个很大的语料库，我正在与tm::tm_map()进行转换。由于我使用托管的R Studio，因此我有15个内核，并希望利用并行处理来加快速度。 没有共享一个非常大的语料库，我简直无法用虚拟数据重现。 我的代码如下。对问题的简短描述是在控制台中手动循环切片，但在我的函数内部不这样做。 函数“clean_corpus”将语料库作为输入，将其分解成片段并保存到临时文件以帮助解决内存问题。然后该函数
    r parallel-processing tm doparallel 2017-08-23

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    foreach与数据库连接冻结，没有错误，永远

    library(doParallel) library(RMySQL) no_cores <- as.integer(system('getconf _NPROCESSORS_ONLN', intern = TRUE)) - 1 cluster <- makeCluster(no_cores) registerDoParallel(cl) clusterEvalQ( clus
    r foreach parallel-processing doparallel 2017-08-24

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    执行富集分析的优化方法

    我正尝试使用phyper函数从R执行富集分析。我写的代码给了我准确的结果，但当矩阵的大小增加时，它会一直持续下去。以下是621 * 1860矩阵的可重现示例。但是，当矩阵的大小增加到6210 X 24000时，即使我在多核上运行，也需要将近一天才能完成。我想知道是否有一种方法来优化相同。 请从评论中的可共享链接下载三个RObjects。 ## Main Functions GetEnriched
    r algorithm foreach doparallel 2017-08-25

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    在r返回使用foreach循环不适用

    我想在R（包foreach + doParallel）中使用“foreach”循环，但在我的工作中，我发现循环返回一些NA，经典的“for”循环返回值我想： library(foreach) library(doParallel) ncore=as.numeric(Sys.getenv('NUMBER_OF_PROCESSORS'))-1 registerDoPar
    r foreach na doparallel 2017-08-28

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    错误调用R中

    结合功能回路的foreach下面的代码： df <- foreach(i = 1:length, .combine = cbind) %dopar% { ... ... m4 } 给我一个错误： error calling combine function: <simpleError in data.frame(..., check.names = FALSE): arguments
    r foreach doparallel 2017-10-18

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    在函数定义中使用foreach与使用foreach写入文件

    在写入文件时，我很难并行化R来优化函数调用的速度。该功能很简单，但它创建的文件很庞大，而且花费的时间也不合理。我一直在使用profvis来查看时间正在发生的地方，看起来嫌疑人在函数结尾处的cat语句中，以及在写入输出文件时的捕获步骤中。我在下面包含了一个简化的，小型的，可重现的示例脚本，但实际的文件非常庞大，我正在超级计算集群上运行它们。以书面形式并行运行代码并不会增加速度，但是我不知道如何构造f
    r foreach parallel-processing doparallel 2017-07-13

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    包含foreach的R包将与doParallel一起使用，但不包含doMPI，找不到对象

    我正试图编写一个R包，它包含foreach语句和doMPI后端内的几个嵌套函数。它抛出一个“无法找到”XXX“对象错误，奇怪的是，如果我使用doParallel作为后端，这个错误不会发生，这是一个问题的例子，但我可以使用一个工作解决方案，doMPI更大的问题。 这是使用RStudio，roxygen已编译为R-Package中的代码，devtools等 #' Test function level
    r foreach parallel-processing doparallel dompi 2017-09-05

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    r doParallel qbeta vs RcppParallel - 如何在满容量时使用内核

    我运行以下示例代码以模拟值，下面是4个内核的使用情况快照。需要一段时间才能全部使用所有核心，我想了解正在发生的事情，最终如何使其更快。 library(doParallel) library(data.table) data<-data.table(a=runif(10000000),b=runif(10000000),quantile=runif(10000000)) e <- nro
    r rcpp doparallel 2017-07-24

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    的foreach％dopar％屈服“找不到函数”的错误时要并行化的功能列表元素

    我已经成功地并行化的功能 - 我们称之为AddOne - 通过doParallel包，foreach和%dopar%和我很熟悉.packages和.export自变量为foreach。 我的问题是，我想AddOne，而不是一个“独立”功能，是一个列表的元素，在这种情况下，我不能让事情工作。具体而言，如果AddOne调用子程序AddOneSubroutine，则AddOneSubroutine在“工
    r foreach doparallel 2017-09-13

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    当预测与foreach并行的nnet输出时发生R内存爆炸

    我有一个（大）神经网络正在R中的nnet包训练。我想能够模拟这个神经网络的预测，并且在并行使用像foreach这样的东西，我之前用过的成功（全部在Windows机器上）。 我的代码的基本形式 library(nnet) data = data.frame(out=c(0, 0.1, 0.4, 0.6), in1=c(1, 2, 3, 4), in2=c(10,
    r parallel-processing neural-network doparallel nnet 2017-09-21
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