itk

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我试图从3D数组中获取图像并将其转换为TIF 3D。我正在使用简单的ITK，但它不起作用。我得到这个错误信息：“的方法 'WriteImage'，参数1型 'ITK ::简单::图片常量&' 这里是我的代码： import numpy as np import SimpleITK as sitk test = np.ones((20,20,20)) sitk.WriteImage(tes

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不能写图像SimpleElastix（蟒蛇）

我试图运行下面的示例作为SimpleElastix库的一部分： import SimpleITK as sitk elastixImageFilter = sitk.ElastixImageFilter() elastixImageFilter.SetFixedImage(sitk.ReadImage('1.jpg', sitk.sitkFloat32)) elastixImageFilt

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如何使用simpleitk获取反向位移字段

我刚刚从matlab移动到Python最近，所以我可以使用simpleitk和抱歉，如果这是一个愚蠢的问题。我使用simpleitk进行恶魔注册之后有一个转换tx。我希望通过执行以下操作来获得位移场及其逆， disp_field = tx.GetDisplacementField() disp_field_inv = tx.GetInverseDisplacementField() 原来d

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为什么ConnectedThresholdImageFilter类不在阈值内标记像素？

我想使用ConnectedThresholdImageFilter类来分割二进制图像（'slice87.jpg'）的“C”看白色区域。这个想法是选择一个位于该区域内的种子值，并且只添加也具有255强度的相邻像素（在阈值254和256之间）。然而，我的代码的结果的图像中的与每一个像素设置为0：代替此（通过Photoshop的手动编辑）：我的种子值是（x，y）=（115,35）。 img.Get

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pydicom：数据集没有属性 'TransferSyntaxUID'

嗨，我是从阅读DICOM文件与pydicom 这个职位的痛苦不同于 pydicom 'Dataset' object has no attribute 'TransferSyntaxUID' 这里是我的代码 import dicom dicom.read_file(file,force=True) 这导致错误 AttributeError Traceback (most rec

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使用Python中的SimpleITK读取mhd文件时出错

我在这里再次讨论关于python中的SimpleITK的另一个问题。我想绘制一个.mhd图像，但我不知道如何。我想在这里说明Reading *.mhd/*.raw format in python功能： load_itk('/home/bianca/Documents/PythonProcessing/result-Edep.mhd') 但它不是读取图像： RuntimeError: Exce

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将3D Numpy阵列放入ITK SNAP

如何将3D Numpy阵列（代表医疗数据的视频）转换为适合ITK-SNAP应用程序进行手动分割的适当文件格式？

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CMake错误：ItkVtkGlue

我建VTK-8.0.0（使用msvc2017_64）和ITK-4.12.0（使用msvc2017_64）。在ITK - 建造如下： 1）构建VTK（CMake3.9.0） 2）构建ITK（CMake3.9.0）：Module_ITKVtkGlue + VTK_DIR this path C:\VTK\8.0.0\build\msvc2017_64 3）VTK使用msvc2017编译（在释放模式）

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使用二进制掩码获取感兴趣的区域itk

我对ITK来说很新，因此几乎没有使用它的经验。我的问题是：我有两个nifti图像：一个医学图像和一个代表感兴趣体积的二进制图像。我想从医学图像中只提取感兴趣区域的区域。我想将该区域的强度值存储在多维数组中。直到现在我读取图像和掩码并将其值存储在多维数组中。我现在可以逐个像素地比较这些值，但我希望可能有更简单的方法？

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ITK尝试注册ImageIOFactory时出现错误

我试图链接到ITK以使用VS2012（ITK版本4.11）读取/写入图像。我用cmake构建了ITK库;然后安装到安装前缀文件夹中。我已经使用了/包括文件夹中的附加在自己的项目文件夹和也使用了以下库作为附加的依赖关系： itksys-4.11.lib itkv3p_netlib-4.11.lib itkvnl_algo-4.11.lib itkvnl-4.11.lib ITKCommon-