rpy2

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Python类通过rpy2执行R函数，并且我希望能够在R函数产生错误的情况下从R捕获回溯。 R代码是遗留的，所以修改它是非常危险的;我宁愿在Python方面做一些事情。这里是Python代码是什么样子目前： from rpy2.rinterface import RRuntimeError from rpy2.robjects import DataFrame from rpy2.robje

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当RPY2导入包时，单独绘制Matplotlib错误帧

在我的计算机（Windows 10，Python 2.7 x86）上安装了RPY2（v.2.7.8）和伴随的依赖关系之后，Matplotlib（1.5.3）似乎有被损坏。甚至最简单的情节，框架和窗口彼此分开描述： series1 = pd.Series(np.arange(500)) series2 = series1*-1 plt.plot(series1,series2) # OUT:

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在Docker上使用rpy2接口运行R模型。我正在面临与开放端口相关的问题

首先，我使用rpy2 python界面在Windows系统中运行R模型。它运行良好。然后，我使用docker将它迁移到linux环境。现在我使用Docker run命令执行相同的代码，面临“rpy2.rinterface.RRuntimeWarning：port 11752无法打开”。注意：我的应用程序使用rpy2运行四个R模型。这意味着它会创建四个机器人。所以我认为他们同时使用同一个端口。但

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如何使用rpy2从python获得n-dim数组

我想使用python进行一些计算，并将数组数据放到r中以获得一些图。对于1维数组，我可以使用FloatVector得到正确的答案，但n维数组错误（运行下面的代码）（2维数组） import numpy as np from rpy2.robjects.vectors import FloatVector x = np.array([[1, 2], [3, 4]]) X = FloatVect

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使用Docker安装rpy2无法找到R路径

使用Docker的Django应用程序需要安装rpy2作为依赖项。虽然我安装R基本容器，并将其指定为依赖，安装Django的需求时，我不断收到： Collecting rpy2==2.8.3 (from -r /requirements/base.txt (line 55)) Downloading rpy2-2.8.3.tar.gz (186kB) Complete outp

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Rpy2 pandas2ri.ri2py（）被转换NA值以整数

我使用Rpy2版本2.8.4结合有R 3.3.0和python 2.7.10创建的R数据帧 import rpy2.robjects as ro from rpy2.robjects import r from rpy2.robjects import pandas2ri df = ro.DataFrame({'Col1': ro.vectors.IntVector([1, 2, 3, 4

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如何使用Stargazer打印适合rpy2

我正在学习如何使用rpy2，并且我想使用stargazer软件包创建格式化的回归输出。我最好的如何做到这一点的猜测是，下面的代码： import pandas as pd import rpy2.robjects as robjects from rpy2.robjects.packages import importr stargazer = importr('stargazer')

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Jupyter笔记本rpy2 Rmagics：如何设置默认绘图大小？

我在Jupyter笔记本中使用了%%R单元魔法。我知道，你可以设置绘图尺寸与每个细胞，例如： %%R -w 800 -h 600 但我想为整个笔记本/ R会话的默认。我已经看了the documentation，看到this blog post on the R Jupyter Notebook Kernel，并通过设置单元格绘图尺寸已经看到Plot Size - Using ggplot2

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在Python中使用rpy2软件包：Rruntime错误未被用户代码处理

我正尝试在使用rpy2软件包的python中创建一个r环境。我试图创建一个我从图像中提取的ROI的GLRLM。我在加载软件包时遇到了一些问题，但我终于设法做到了。现在我在运行代码时出现以下错误： RuntimeError was unhandled by user code 在这一行： ro.r('glrlmatrix <- radiomics:::glrlm(tissue)') 我怀疑它无法找到

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大熊猫据帧到rpy2数据帧生成我不需要的数据

代码示例 df.to_csv("output_df.csv", sep=',', encoding='utf-8') df2 = pandas2ri.py2ri(df) df2.to_csvfile("output_df2.csv") 问题描述我想我的大熊猫data.frame（DF）转换成rpy2 data.frame。但不幸的是，它会产生大量不需要的数据。数据中不