在R中构造一个由两个向量组成的转换矩阵

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我正在尝试可视化过程的转换频率。我有以下数据>在R中构造一个由两个向量组成的转换矩阵

from to 
1 4 
4 5 
1 3 
1 3 
4 5 
...

我所要做的是创建这些转变的频率矩阵的热图，所以对于上面的示例，

之前，我另起炉灶，在那里R中的任何预定义的函数，可以给我这样的结果？

谢谢！

来源

2016-10-03 sdgaw erzswer

重的欺骗目标（见thelatemail答案），你需要：'列弗< - 排序（由工会（DF $，$ DF对））;表（因子（df $ from，levs），因子（df $ to，levs））' – Cath

另请看'igraph :: from_adjacency'。 – Axeman

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试试这个：

df 

    from to 
1 1 4 
2 4 5 
3 1 3 
4 1 3 
5 4 5 

df$count <- 1 
df <- aggregate(count~from+to, data=df, sum) 
nodes <- unique(c(df$from,df$to)) 
df1 <- merge(expand.grid(from=nodes, to=nodes), df, by=c('from','to'), all=TRUE) 
df1$count[is.na(df1$count)] <- 0 
library(reshape2) 
dcast(df1, from~to, value.var = 'count') 

    from 1 3 4 5 
1 1 0 2 1 0 
2 3 0 0 0 0 
3 4 0 0 0 2 
4 5 0 0 0 0

来源

2016-10-03 06:40:58

谢谢，这个作品！ –

在R中构造一个由两个向量组成的转换矩阵

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