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我点的numpy的数组:欧几里得距离
points = rand(dim, n_points)
我需要:
- 计算所有L2范数(欧几里得距离)的某个点和所有其他之间分数
- 计算所有成对距离。
并且最好是所有的numpy和no的。如何做到这一点?
我点的numpy的数组:欧几里得距离
points = rand(dim, n_points)
我需要:
并且最好是所有的numpy和no的。如何做到这一点?
如果你愿意使用SciPy的,在scipy.spatial.distance
模块(功能cdist
和/或pdist
)你想要什么,所有的在C.循环做,你可以用广播做到这一点,但有一些额外的内存开销。
这可能与第二部分帮助:
import numpy as np
from numpy import *
p=rand(3,4) # this is column-wise so each vector has length 3
sqrt(sum((p[:,np.newaxis,:]-p[:,:,np.newaxis])**2 ,axis=0))
这给
array([[ 0. , 0.37355868, 0.64896708, 1.14974483],
[ 0.37355868, 0. , 0.6277216 , 1.19625254],
[ 0.64896708, 0.6277216 , 0. , 0.77465192],
[ 1.14974483, 1.19625254, 0.77465192, 0. ]])
如果p是
array([[ 0.46193242, 0.11934744, 0.3836483 , 0.84897951],
[ 0.19102709, 0.33050367, 0.36382587, 0.96880535],
[ 0.84963349, 0.79740414, 0.22901247, 0.09652746]])
并且你可以通过
检查中的一个条目sqrt(sum ((p[:,0]-p[:,2])**2))
0.64896708223796884
诀窍是把newaxis,然后做广播。
祝你好运!