持续集成（Hudson/Jenkins）和R编程

有谁知道一种方法来与R编程持续集成吗？我知道像svUnit软件包这样的工具可以进行单元测试，但是有没有人试图用Hudson/Jenkins运行这些工具？持续集成（Hudson/Jenkins）和R编程

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2011-08-09 Travis Nelson

+1我也对此感兴趣，以便自动从CRAN中捕获打破我的测试的软件包更新。我希望我能够轻松地向上游发送一堆测试，以帮助软件包开发人员，但是自动化测试现在可以完成。 – Iterator

只是想知道@Iterator还是Travis试用了最新的svUnit。根据我的说法，svUnit在Jenkins中提供了非常好的整合，所以看到Dirks回答“被接受”，这让我觉得你还没有把它推进。 – mariotomo

@mariotomo - 感谢您的提醒 - 我一定会检查出来。我有一个即将到来的项目需要使用这样的测试。 – Iterator

我没有看到任何特别的问题。这些东西往往是脚本所以可以只

点到你的仓库顶部
ň分钟每个签入，遍历源目录后
每个
调用R CMD check您包必须设置为使用单元测试，您可以使用这些单元测试
- RUnit这是初始单元测试g表示R;它被广泛应用于
- testthat这是哈德利更新包，并通过他的许多包
- svUnit由Philippe其中AFAIK从来没有流行起来是完全一样的另外两个使用。

那可真是不从编译语言的持续集成任何不同。你的问题实际上是关于如何在R中进行单元测试，而这个问题已经被覆盖过。

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2011-08-09 21:36:13

你写的是非常真实的 - 一般来说，这个问题明确提到Jenkins/Hudson，据我所知，[svUnit]提供了最好的集成（https://r-forge.r-project.org/scm /viewvc.php/pkg/svUnit/R/?root=sciviews）。看到我的其他答案。 ...国际海事组织，只要能够执行脚本单元测试，如果结果的格式不符合所选的持续集成工具，就没有多大用处。 – mariotomo

如果R CMD检查失败，任何关于让Jenkins显示构建的建议都失败了？ –

当然，看看有'dump_logs'函数的新的[github上的r-travis项目]（https://github.com/craigcitro/r-travis）。 –

Hudson/Jenkins支持运行bash脚本。我认为你可以用它作为你的R世界的入口。在R中，保持结果的一种简单方法是使用sink（“toYourFile.txt”），然后使用CI的结果显示函数来显示toYourFile.txt。

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2012-04-12 15:07:12 Leo5188

很容易让CI显示文件，你如何得到它来识别错误？ –

“如何识别错误？”，您需要输出的格式可以被Jenkins识别，这正是您可以使用“junit”协议对svUnit所做的事情。 – mariotomo

在办公室我们一直在使用Hudson/Jenkins。我贡献了integration of svUnit to Jenkins，所以我强烈建议你在尝试其他方面之前使用svUnit。

看看我维护的两个库：logging和delftfews或在我自己试图按照zoo和redistribute it on github。

我最近一直没做家务，所以这三个脚本（在zoo,logging,delftfews）都略有不同。如果任何测试失败，我的动物园版本中的一个将停止。这在您运行R CMD check时很实用，但在进行持续集成时可能不是一个好主意。

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2012-05-07 08:07:23 mariotomo

你能澄清如何触发詹金斯失败，或者在svUnit代码中提到的地方？我无法在svUnit软件包文档或小插图中找到任何相关文本，而且我从您编写的脚本（我是CI新手）中不清楚什么会触发Jenkins通过/失败。它只是回应stderr吗？ –

你说你是新来的CI，我建议你阅读Jenkin的手册以了解它的结构，也许你想看一下正在工作的Jenkins服务器？（例如：https://csvjdbc.ci.cloudbees.com/job/csvjdbc/）你的源代码中的任何已提交的更改将触发Jenkins运行你注册的任何脚本，并且在脚本成功完成后，它将使用生成的报告发布成功/失败/跳过的测试。 – mariotomo

您是如何根据报告设置成功/失败的？詹金斯的标准是？ – bobK

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