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ff对象长度限制为64位Windows中的32位整数

2013-07-25 61 views
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我在64位Windows中使用64位R。但是，运行下面的语句时ff对象长度限制为64位Windows中的32位整数

fi <- ff(vmode="integer", length=2147483648)

R上产生一个错误信息说

length must be between 1 and .Machine$integer.max

这没有良好的意识为64位R.有没有办法避免这种限制？

来源

2013-07-25 Tae-Sung Shin

+1

看看你的（未指定的）64位版本R中的.Machine $ integer.max（它会一直是它的）。 R 3.0+确实允许更长的53位索引（数字尾数的长度），所以ff的作者可能还没有在代码中改变他们的测试。 –

+1

http://google-opensource.blogspot.ca/2011/11/bringing-64-bit-data-to-r.html –

+0

您使用的是哪个版本的R？ > = R 3.0.0？ –

回答

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我通过更改/重新编译软件包的源代码解决了这个问题。

在ff的许多功能中，我只需要创建ff对象并调用get/set下标方法，因此我的范围足够狭窄，足以让我在一夜之间完成此操作，但所有功劳都归功于组织原作者源很好。实际上，作者为这个问题做好了准备，并为不同类型的索引和大小制作了C宏。我只是用C宏来做我想做的事。

这里大概是我做的。

  1. 传递的大小和页大小至C功能new当删除FF对象的尺寸为（长度）的所有错误检查整数在FF功能
  2. 使用as.double代替as.integer的。

  3. 在ff.h，我重新定义下面的宏和ff.cpp其相应部分

    #define FF_DECL_TYPE(NAME,TYPE) \ 
    FF_DECL_TYPE2(NAME,TYPE,int,int) \ 
    FF_DECL_TYPE2(NAME##_d,TYPE,double,double)
  4. 在r_ff.c的r_ff_new方法

    ，带* _d_new替换所有* _new功能和使用asReal代替asInteger为LEN和PAGESIZE

我相信还有更多的事情要做，但在我最初的测试，我可以在我的问题执行上面的语句，并可能获取/设置R.我数组的任何元素对象是预处理和分析，例如，30 GB的数据立方体不离开R.我就这么接近。

来源

2013-07-26 14:16:47

+1

不错！如果将它包含在ff软件包中会很棒！ – jwijffels

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@jwijffels虽然我的改变还没有完成，但我愿意为有机会做出贡献。一旦我完成（测试/调试）这个改变，我会尝试联系作者。 –

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