2012-09-21 108 views
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假设我有一个熊猫数据帧df数据标准化

我要计算一个数据帧的逐列平均值。

这是容易的:

df.apply(average) 

然后逐列范围内的最高(COL) - 最小(COL)。这又是很容易:

df.apply(max) - df.apply(min) 

现在对于我希望通过其列的范围内减去其列的平均值,然后除以每个元素。我不知道该怎么做

任何帮助/指针非常感谢。

回答

143
In [92]: df 
Out[92]: 
      a   b   c   d 
A -0.488816 0.863769 4.325608 -4.721202 
B -11.937097 2.993993 -12.916784 -1.086236 
C -5.569493 4.672679 -2.168464 -9.315900 
D 8.892368 0.932785 4.535396 0.598124 

In [93]: df_norm = (df - df.mean())/(df.max() - df.min()) 

In [94]: df_norm 
Out[94]: 
      a   b   c   d 
A 0.085789 -0.394348 0.337016 -0.109935 
B -0.463830 0.164926 -0.650963 0.256714 
C -0.158129 0.605652 -0.035090 -0.573389 
D 0.536170 -0.376229 0.349037 0.426611 

In [95]: df_norm.mean() 
Out[95]: 
a -2.081668e-17 
b 4.857226e-17 
c 1.734723e-17 
d -1.040834e-17 

In [96]: df_norm.max() - df_norm.min() 
Out[96]: 
a 1 
b 1 
c 1 
d 1 
+14

这是如此明显,我的思想不能接受它:) – jason

+0

有没有办法做到这一点,如果你想正常化的子集?假设“A”和“B”行是您想要与“C”和“D”分开归一化的更大分组因子的一部分。 – Amyunimus

+0

像以前一样选择子集并进行计算。关于如何索引和选择数据,请参阅http://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/indexing.html –

23

您可以使用apply了这一点,这是一个有点整洁:

import numpy as np 
import pandas as pd 

np.random.seed(1) 

df = pd.DataFrame(np.random.randn(4,4)* 4 + 3) 

      0   1   2   3 
0 9.497381 0.552974 0.887313 -1.291874 
1 6.461631 -6.206155 9.979247 -0.044828 
2 4.276156 2.002518 8.848432 -5.240563 
3 1.710331 1.463783 7.535078 -1.399565 

df.apply(lambda x: (x - np.mean(x))/(np.max(x) - np.min(x))) 

      0   1   2   3 
0 0.515087 0.133967 -0.651699 0.135175 
1 0.125241 -0.689446 0.348301 0.375188 
2 -0.155414 0.310554 0.223925 -0.624812 
3 -0.484913 0.244924 0.079473 0.114448 

而且,它与groupby工作得很好,如果你选择相关的列:

df['grp'] = ['A', 'A', 'B', 'B'] 

      0   1   2   3 grp 
0 9.497381 0.552974 0.887313 -1.291874 A 
1 6.461631 -6.206155 9.979247 -0.044828 A 
2 4.276156 2.002518 8.848432 -5.240563 B 
3 1.710331 1.463783 7.535078 -1.399565 B 


df.groupby(['grp'])[[0,1,2,3]].apply(lambda x: (x - np.mean(x))/(np.max(x) - np.min(x))) 

    0 1 2 3 
0 0.5 0.5 -0.5 -0.5 
1 -0.5 -0.5 0.5 0.5 
2 0.5 0.5 0.5 -0.5 
3 -0.5 -0.5 -0.5 0.5 
48

如果您不介意导入sklearn库,我会推荐在this博客上讨论的方法。

import pandas as pd 
from sklearn import preprocessing 

data = {'score': [234,24,14,27,-74,46,73,-18,59,160]} 
df = pd.DataFrame(data) 
df 

min_max_scaler = preprocessing.MinMaxScaler() 
np_scaled = min_max_scaler.fit_transform(df) 
df_normalized = pd.DataFrame(np_scaled) 
df_normalized 
+2

到博客帖子的链接已经死亡。你有工作吗? – marts

+0

@marts完成...! – astrojuanlu

+3

创建单位正态归一化数据的相应方法称为StandardScaler。 – abeboparebop

2

从稍加修改:Python Pandas Dataframe: Normalize data between 0.01 and 0.99?但一些评论认为这是相关的(对不起,如果认为是转贴,虽然...)

我想在基准或z的,经常百分定制正常化分数不够。有时候我知道人口的可行最大和最小值是什么,因此想要定义它,而不是我的样本,或者不同的中点,或者其他任何东西!这通常对于神经网络的数据重新缩放和标准化非常有用,您可能希望所有输入介于0和1之间,但某些数据可能需要以更加自定义的方式进行缩放......因为百分比和stdevs假设您的样本覆盖人口,但有时我们知道这是不正确的。在热图中可视化数据对我来说也非常有用。所以,我建立了一个自定义函数(用在代码中加入额外步骤,在这里,使其尽可能地易读):

def NormData(s,low='min',center='mid',hi='max',insideout=False,shrinkfactor=0.):  
    if low=='min': 
     low=min(s) 
    elif low=='abs': 
     low=max(abs(min(s)),abs(max(s)))*-1.#sign(min(s)) 
    if hi=='max': 
     hi=max(s) 
    elif hi=='abs': 
     hi=max(abs(min(s)),abs(max(s)))*1.#sign(max(s)) 

    if center=='mid': 
     center=(max(s)+min(s))/2 
    elif center=='avg': 
     center=mean(s) 
    elif center=='median': 
     center=median(s) 

    s2=[x-center for x in s] 
    hi=hi-center 
    low=low-center 
    center=0. 

    r=[] 

    for x in s2: 
     if x<low: 
      r.append(0.) 
     elif x>hi: 
      r.append(1.) 
     else: 
      if x>=center: 
       r.append((x-center)/(hi-center)*0.5+0.5) 
      else: 
       r.append((x-low)/(center-low)*0.5+0.) 

    if insideout==True: 
     ir=[(1.-abs(z-0.5)*2.) for z in r] 
     r=ir 

    rr =[x-(x-0.5)*shrinkfactor for x in r]  
    return rr 

这将需要在熊猫系列,甚至只是一个列表,并将其归到自己指定的低,中心和高点。还有一个收缩因素!以允许您将数据从端点0和1中缩小(我必须在matplotlib中将色彩图组合在一起时执行此操作):因此,您可能会看到代码的工作方式,但基本上说您具有值[-5,1, 10],但是想要基于-7到7的范围进行归一化(因此大于7的任何数值,我们的“10”被有效地视为7),中点为2,但缩小到适合256 RGB颜色表:

#In[1] 
NormData([-5,2,10],low=-7,center=1,hi=7,shrinkfactor=2./256) 
#Out[1] 
[0.1279296875, 0.5826822916666667, 0.99609375] 

它也可以把里面你的数据...这似乎很奇怪,但我发现它有用heatmapping。假设你想要一个更接近0的值而不是hi/low值较深的颜色。你可以热图基于标准化的数据,其中insideout = TRUE:

#In[2] 
NormData([-5,2,10],low=-7,center=1,hi=7,insideout=True,shrinkfactor=2./256) 
#Out[2] 
[0.251953125, 0.8307291666666666, 0.00390625] 

所以现在“2”,这是最接近中心,定义为“1”为最高值。

无论如何,我认为我的应用程序是相关的,如果你想以其他方式重新调整数据,可能会有用的应用程序给你。

+0

你可以用[带有函数的字典]替换所有的if/else语句(https://stackoverflow.com/questions/60208/replacements-for-switch-statement-in-python)。看起来更清洁一点。 – Roald

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非常整齐,下次我会记住这一点,谢谢! – Vlox