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我试图做一个堆叠的条形图,X轴是时间,Y轴是金额,填充颜色是某些功能。ggplot堆积条形图的x值和没有y /填充值
我的数据看起来是这样的:
> base
Number Mut Time Percent
1 117 22:A->G 2 81.81
2 13 24:G->A 2 9.09
3 10 22:A->G 24:G->A 108:G->A 158:G->A 162:G->A 2 6.99
4 1 22:A->G 24:G->A 2 0.69
5 32 24:G->A 3 94.11
6 1 24:G->A 162:G->T 3 2.94
7 1 24:G->A 82:G->T 3 2.94
当我使用的代码做一个堆积条形图中ggplot:
ggplot(base,aes(x = Time, fill = Mut, y = Percent)) + geom_bar(stat='identity') + theme(legend.key.size = unit(.5, "cm")) + ylab("Number")
我得到类似如下的图表:
http://imgur.com/32XCkTm,yfCAJsx#0
我的问题是我想那里有零值fo R个时间= 1和时间= 4
事情与此类似:
http://imgur.com/32XCkTm,yfCAJsx#1
有没有一种方法,我可以做到这一点?现在,我只是说0值数据为时间1和4,并加入我的填充功能(MUT)是一个已经在数据出现了:
> base
Reads Mut Time Percent
1 0 22:A->G 1 0.00
2 117 22:A->G 2 81.81
3 13 24:G->A 2 9.09
4 10 22:A->G 24:G->A 108:G->A 158:G->A 162:G->A 2 6.99
5 1 22:A->G 24:G->A 2 0.69
6 32 24:G->A 3 94.11
7 1 24:G->A 162:G->T 3 2.94
8 1 24:G->A 82:G->T 3 2.94
9 0 22:A->G 4 0.00
我的问题是我不希望有继续搜索已经在数据中的特征(Mut)。有没有一种方法可以让ggplot自动将时间= 1和时间= 4的x值放入没有条形图的图形中,而无需向数据添加值?我一直在寻找几个小时,找不到任何答案。
谢谢。
只是让 “时间” 的一个因素。 'base $ Time < - factor(base $ Time,levels = 1:4)'。这样'ggplot'将会“知道”关于缺失的值。 – MrFlick
这工作得很好,谢谢! –