如何存储在Gephi可视化networkx图？

Question

我正在使用Networkx模块Python中的PageRank算法。我有列表，一个字典在字典的关键是页面的标题，它的价值是通过页面引用的所有标题。

因此，为了创造一个可视化的，我第一次做这样的：

G = nx.DiGraph() 
G = nx.from_dict_of_lists(ref_dict) 

其中ref_dict是上面提到的字典。

创建图表后，我使用Networkx的write_edgelist功能存储CSV格式的图形。

nx.write_edgelist(subG,'PageRanks2.csv') 

这里是我的问题。 csv文件正在存储边缘为：

节点1节点2 {} node1上节点3 {}

在我使用此文件直接在Gephi，它将该{}为节点，并显示相应的可视化。 那么应该怎么来存储networkx图形可视化它的最佳格式？

Answer 1

您可以指定data参数networkx告诉不添加{}：

nx.write_edgelist(subG,'PageRanks2.csv', data=False) 

还有其他格式，这些格式都networkx和GEPHY支持（如GraphML），并且可以完成，如果更复杂的数据可视化任务您的数据具有与其关联的属性。

Answer 2

使用write_gexf函数，如：nx.write_gexf（G，“test.gexf”）， 并使用Gephi打开文件，然后您将在getphi中看到它。

参考https://networkx.github.io/documentation/networkx-1.10/reference/generated/networkx.readwrite.gexf.write_gexf.html#write-gexf