在R包中找不到函数？

我一直在使用minfi R包。当我与另一台计算机一起工作时，所有功能都可以正常工作。我在我自己的笔记本电脑中安装了minfi 2天。大多数功能工作正常，但是当我使用具有功能preprocessSWAN()的命令时，我得到的错误在R包中找不到函数？

Error: could not find function ¨proprocessSWAN¨

我得到这个错误每次我只用此功能工作，在运行我分析的中间。

我也曾尝试重新安装minfi以查看安装过程中是否出现问题。但即使重新安装后，我也发现了同样的问题。这个功能在我的Windows和其他电脑上都能正常工作。

谁能告诉我为什么我在我的Ubuntu上有这个问题？我该怎么做才能使它工作？

来源

2012-09-19 Letin

这不是一个错字吗？它在你的问题中第二次说“proprocess”。如果不尝试getFromNamespace（“preprocessSWAN”，“minfi”）'。它几乎不可能从包中被删除，但具有这样一个特定的名称，它不可能被另一种方法覆盖。 – Backlin

@Backlin：这肯定不是一个错字。我在这里错误地键入了'pro'，但是我在R中查了几次。我也尝试了getFromNamespace（“preprocessSWAN”，“minfi”），但它说错误在get（x，envir = ns，inherits = FALSE）中： object'preprocessSWAN'not found – Letin

我会建议检查你在每台机器上有相同的版本。看包NEWS，建议preprocessSWAN()是相当新的。所以，看看：

library(minfi) 
packageVersion("minfi")

在您拥有的每台机器上。我意识到你更新了你的软件包，但是你真的需要检查你的所有bioconductor软件包是否是最新的。所以，试试这样的：

url='http://bioconductor.org/biocLite.R' 
source(url) 
update.packages(repos=biocinstallRepos())

此外，你是否运行相同版本的R？在两台机器上输入version。要获得相同的bioconductor版本，你会（我认为）需要相同版本的R.因此，你可能需要升级R.

来源

2012-09-19 13:28:27 csgillespie

非常感谢您的帮助@csgillespie。我正在努力升级R.并且很抱歉将它作为答案发布。 – Letin

在R包中找不到函数？

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