r：使用库读取libsvm文件（e1071）

我已经使用org.apache.spark.mllib.util.MLUtils包在scala中生成了一个libsvm文件。r：使用库读取libsvm文件（e1071）

的文件格式是如下：

m= read.matrix.csr(filename)

所得matrix.csr的结构如下：：

49.0 109:2.0 272:1.0 485:1.0 586:1.0 741:1.0 767:1.0 
49.0 109:2.0 224:1.0 317:1.0 334:1.0 450:1.0 473:1.0 592:1.0 625:1.0 647:1.0 
681:1.0 794:1.0 
17.0 26:1.0 109:1.0 143:1.0 198:2.0 413:1.0 476:1.0 582:1.0 586:1.0 611:1.0 
629:1.0 737:1.0 
12.0 255:1.0 394:1.0 
etc etc

我使用e1071包如下读取文件划分成r

$ x:Formal class 'matrix.csr' [package "SparseM"] with 4 slots 
    .. [email protected] ra  : num [1:31033] 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 ... 
    .. [email protected] ja  : int [1:31033] 109 272 485 586 741 767 109 224 317 334 ... 
    .. [email protected] ia  : int [1:2996] 1 7 18 29 31 41 49 65 79 83 ... 
    .. [email protected] dimension: int [1:2] 2995 796 
$ y: Factor w/ 51 levels "0.0","1.0","10.0",..: 45 45 10 5 42 25 23 41 23 25 ...

当我转换为一个密集矩阵与as.matrix（m）它会产生一列和两行，ea与一个不可解释的（由我）对象在其中。

当我只是尽量节省matrix.csr回文件（没有做任何中间处理），我收到以下错误：

Error in abs(x) : non-numeric argument to mathematical function

我猜测的LIBSVM格式是不兼容的，但我我真的不确定。任何帮助将不胜感激。

来源

2017-09-26 Jake

确定，它的短：

m= read.matrix.csr(filename)$x

因为read.matrix.csr是有两个元素的列表;矩阵和一个向量。换句话说，目标/标签/类是从特征矩阵中分离出来的。

注意同胞[R新手：在克兰文件，似乎“值”副标题指的是函数的返回值

Value

If the data file includes no y variable, read.matrix.csr returns an object of class matrix.csr,

else a list with components:

x object of class matrix.csr

y vector of numeric values or factor levels, depending on fac

来源

2017-09-27 01:33:44 Jake

r：使用库读取libsvm文件（e1071）

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