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我的项目在Linux机器上开发环境为CUDA 4.2。Cuda 5.0链接错误
最近它升级到CUDA 5.0，现在编译失败并显示以下错误消息。
In file included from /opt/cuda/bin/crt/link.stub:79:0:
/tmp/tmpxft_000018c8_00000000-1_GPUReax_dlink.reg.c:2:1: error: redefinition of 'const unsigned char def_module_id_str__NV_MODULE_ID []'
/tmp/tmpxft_000018c8_00000000-1_GPUReax_dlink.reg.c:1:1: error: 'const unsigned char def_module_id_str__NV_MODULE_ID [19]' previously defined here
/tmp/tmpxft_000018c8_00000000-1_GPUReax_dlink.reg.c: In function 'void __cudaRegisterLinkedBinary__NV_MODULE_ID(void (*)(void**), void*, void*)':
/tmp/tmpxft_000018c8_00000000-1_GPUReax_dlink.reg.c:2:1: error: redefinition of 'void __cudaRegisterLinkedBinary__NV_MODULE_ID(void (*)(void**), void*, void*)'
/tmp/tmpxft_000018c8_00000000-1_GPUReax_dlink.reg.c:1:1: error: 'void __cudaRegisterLinkedBinary__NV_MODULE_ID(void (*)(void**), void*, void*)' previously defined here
我使用的是Linux机器
mctesla 93 $ uname -a
Linux mctesla.cs.purdue.edu 3.7.1 #1 SMP Fri Dec 28 12:08:12 EST 2012 x86_64 Intel(R) Xeon(R) CPU E5606 @ 2.13GHz GenuineIntel GNU/Linux
mctesla 94 $
可有人请就如何解决与CUDA 5.0环境这一问题发表评论。
更新-----
感谢您的迅速评论。
我昨天花了一整天追着这个问题..看着编译器的输出后，我发现下面的行....
NVCC -I（由*下面分开）。 -I/opt/cuda/include -D__USE_GPU__ -arch = sm_20 -Xptxas = -v -L/opt/cuda/lib64 -lm -lz -lcuda -lcudart GMRES.o QEq.o allocate.o analyze.o bond_orders.o box.o forces.o four_body_interactions.o grid.o init_md.o integrate.o list.o lookup.o neighbors.o param.o pdb_tools.o print_utils.o reset_utils.o restart.o single_body_interactions.o system_props.o three_body_interactions。 o traj.o two_body_interactions.o vector.o testmd.o cuda_utils.o cuda_copy.o cuda_init.o reduction.o center_mass.o helpers.o validation.o matrix.o matvec.o -o GPUReax
在包含的文件中从/opt/cuda/bin/crt/link.stub:79:0 :(*） /tmp/tmpxft_0000345f_00000000-1_GPUReax_dlink.reg.c:2:1：错误：的“const的无符号字符def_module_id_str__NV_MODULE_I重新定义d []” /tmp/tmpxft_0000345f_00000000-1_GPUReax_dlink.reg.c:1:1：错误： 'const的无符号字符def_module_id_str__NV_MODULE_ID [19]' 先前此处定义
错误是从文件link.stub未来文件，这是CUDA 5.0安装中的新增功能。该文件不在CUDA 4.2安装中。
如果这可以帮助别人指出问题。
感谢您的帮助。
苏德赫Kylasa
顺便说一句，这是我的Makefile
CC = g++
NVCC = nvcc
LIBS = -L/opt/cuda/lib64 -lm -lz -lcuda -lcudart
CFLAGS = -I. -Wall -O3 -funroll-loops -fstrict-aliasing
NVCCFLAGS = -I. -I/opt/cuda/include -D__USE_GPU__ -arch=sm_20 -Xptxas=-v
#-finline-functions -finline-limit=15 -g#-DTEST -pg -ldl -rdynamic -g
DEFS = $(CFLAGS)
NVCCDEFS = $(NVCCFLAGS)
FLAG = $(DEFS) $(INCS) $(LIBS)
NVCCFLAG = $(NVCCDEFS) $(LIBS)
OBJ = GMRES.o QEq.o allocate.o analyze.o bond_orders.o \
box.o forces.o four_body_interactions.o \
grid.o init_md.o integrate.o list.o \
lookup.o neighbors.o param.o pdb_tools.o \
print_utils.o reset_utils.o \
restart.o single_body_interactions.o \
system_props.o three_body_interactions.o \
traj.o two_body_interactions.o vector.o \
testmd.o \
cuda_utils.o cuda_copy.o cuda_init.o reduction.o \
center_mass.o helpers.o validation.o matrix.o matvec.o
all: beta
beta: $(OBJ) Makefile
$(NVCC) $(NVCCFLAG) $(OBJ) -o GPUReax
param.o: param.c param.h mytypes.h traj.o
$(CC) $(DEFS) -c param.c
traj.o: traj.c traj.h mytypes.h
$(CC) $(DEFS) -c traj.c
restart.o: restart.c restart.h mytypes.h box.h
$(CC) $(DEFS) -c restart.c
pdb_tools.o: pdb_tools.c pdb_tools.h mytypes.h box.h list.h restart.h param.h
$(CC) $(DEFS) -c pdb_tools.c
print_utils.o: print_utils.h print_utils.c
$(CC) $(DEFS) -c print_utils.c
grid.o: grid.h grid.c
$(CC) $(DEFS) -c grid.c
analyze.o: analyze.h analyze.c
$(CC) $(DEFS) -c analyze.c
integrate.o: integrate.h integrate.c
$(CC) $(DEFS) -c integrate.c
vector.o: vector.h vector.cu
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c vector.cu
system_props.o: system_props.h system_props.cu
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c system_props.cu
cuda_copy.o: cuda_copy.h cuda_copy.cu
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c cuda_copy.cu
cuda_utils.o: cuda_utils.h cuda_utils.cu
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c cuda_utils.cu
cuda_init.o: cuda_init.h cuda_init.cu
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c cuda_init.cu
reduction.o: reduction.h reduction.cu
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c reduction.cu
center_mass.o: center_mass.h center_mass.cu
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c center_mass.cu
box.o: box.h
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c box.cu
init_md.o: init_md.h init_md.cu
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c init_md.cu
helpers.o: helpers.h helpers.cu
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c helpers.cu
GMRES.o: GMRES.h GMRES.cu
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c GMRES.cu
neighbors.o: neighbors.cu neighbors.h
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c neighbors.cu
reset_utils.o: reset_utils.h reset_utils.cu mytypes.h list.h vector.h
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c reset_utils.cu
list.o: list.h
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c list.cu
forces.o: forces.h forces.cu
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c forces.cu
allocate.o: allocate.h allocate.cu
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c allocate.cu
lookup.o: lookup.h lookup.cu
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c lookup.cu
two_body_interactions.o: two_body_interactions.h two_body_interactions.cu
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c two_body_interactions.cu
bond_orders.o: bond_orders.h bond_orders.cu
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c bond_orders.cu
single_body_interactions.o: single_body_interactions.h single_body_interactions.cu
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c single_body_interactions.cu
three_body_interactions.o: three_body_interactions.h three_body_interactions.cu
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c three_body_interactions.cu
four_body_interactions.o: four_body_interactions.h four_body_interactions.cu
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c four_body_interactions.cu
validation.o: validation.h validation.cu
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c validation.cu
matrix.o: matrix.h matrix.cu
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c matrix.cu
QEq.o: QEq.h QEq.cu
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c QEq.cu
matvec.o: matvec.h matvec.cu
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c matvec.cu
testmd.o: testmd.cu mytypes.h param.o traj.o restart.o pdb_tools.o list.o vector.o
$(NVCC) $(NVCCDEFS) -c testmd.cu
clean:
rm -f *.o *~ core
我的猜测是CUDA 4.2的遗留问题仍然存在于您的机器上（构建环境或项目），因此您最终会混合使用库或同时链接到两个版本。 –
也许给你的编译命令（nvcc命令行）可能有所帮助。如果这是一个项目，你可以做一个“干净”或类似的，这可能会有所帮助。您是否可以构建其他CUDA应用程序，或者在尝试构建时是否都以类似方式失败？ –
你做了一个“干净”吗？ –