如何从github手动或离线安装R包

Question

我尝试从github下载tsdyn包（它尚未更新到cran），但是我的代理阻止了我连接到github。

library(devtools) 
install_github("MatthieuStigler/tsDyn", ref="Dev94", subdir="tsDyn") 

Downloading github repo MatthieuStigler/tsDyn@Dev94 
Erreur dans function (type, msg, asError = TRUE) : 
Failed to connect to api.github.com port 443: Connection refused 

然后我下载的.zip并试图从.zip文件安装包，并得到这个错误：

Erreur dans read.dcf(file.path(pkgname, "DESCRIPTION"), c("Package",  "Type")) : 
impossible d'ouvrir la connexion 
De plus : Message d'avis : 
In read.dcf(file.path(pkgname, "DESCRIPTION"), c("Package", "Type")) : 
impossible d'ouvrir le fichier compressé 'tsDyn-master/DESCRIPTION', cause probable : 'No such file or directory' 

我不明白，因为我能找到的信息库中的描述文件。 我认为它是试图连接到互联网，这是我的专业connexion不允许的。 我发现有些人用Linux成功地让它通过另一个端口下载比443（端口8000必须被允许我认为但不确定），但我有Windows 7. 我有管理员凭据，它不工作，无论是当我尝试使用R作为管理员。 我真的不知道任何有关代理配置的信息，所以如果您有任何想法，请尝试成为我应该做的更具体的行动。

非常感谢提前！

EDIT1：我想你的建议，并删除文件库中的不必要的水平，我做了一个

Rscript -e "install.packages ('C:/Users/stephanie/Downloads/tsDyn.zip',repos=NULL) " 

，我从终端得到了“安装包到“C：/用户/斯蒂芬妮/文档/R/win-library/3.1'（因为'lib'是未指定的）。它似乎工作，但是当我在RI中使用命令库（tsDyn）时得到了“Erreur dans library（tsDyn）”，'tsDyn'n'est pas un nom correct de packageinstallé“（不是我用英文安装的软件包的正式名称）尽管这些文件存在于win库中，但我注意到其他软件包目录中总是存在的文件MD5和INDEX是这里不存在一个想法？

EDIT2：我找到了解决办法，撤除劝不必要的水平，我下次使用devtools的安装功能，它的工作（脱机）...

library(devtools) 
install("C:/Users/stephanie/Downloads/tsDyn") 

我真的不明白与差异终端命令如此，如果有人可以给我线索，我已经解决了我的PB，但我会有兴趣了解如何！

Answer 1

上移的一切行动一个水平，使你没有一个中间文件夹，名为tsDyn并可以：

install_github("MatthieuStigler/tsDyn") 

或留下的东西，因为他们和

install_github("MatthieuStigler/tsDyn/tsDyn") 

证明是在布丁

library(devtools) 
install_github("MatthieuStigler/tsDyn/tsDyn") 

    # Downloading github repo MatthieuStigler/tsDyn@master 
# Installing tsDyn 
# "C:/PROGRA~1/R/R-31~1.2/bin/x64/R" --vanilla CMD INSTALL \ 
# "C:/Users/dominic/AppData/Local/Temp/RtmpiwFHUz/devtools30d0779d2870/MatthieuStigler-tsDyn-8048816/tsDyn" \ 
# --library="D:/Copy/R/win-library/3.1" --install-tests 
# 
# * installing *source* package 'tsDyn' ... 
# ** libs 
# 
# *** arch - i386 
# gcc -m32 -I"C:/PROGRA~1/R/R-31~1.2/include" -DNDEBUG  -I"d:/RCompile/CRANpkg/extralibs64/local/include"  -O3 -Wall -std=gnu99 -mtune=core2 -c llar.c -o llar.o 
# gcc -m32 -I"C:/PROGRA~1/R/R-31~1.2/include" -DNDEBUG  -I"d:/RCompile/CRANpkg/extralibs64/local/include"  -O3 -Wall -std=gnu99 -mtune=core2 -c misc.c -o misc.o 
# gcc -m32 -I"C:/PROGRA~1/R/R-31~1.2/include" -DNDEBUG  -I"d:/RCompile/CRANpkg/extralibs64/local/include"  -O3 -Wall -std=gnu99 -mtune=core2 -c search.c -o search.o 
# gcc -m32 -shared -s -static-libgcc -o tsDyn.dll tmp.def llar.o misc.o search.o -Ld:/RCompile/CRANpkg/extralibs64/local/lib/i386 -Ld:/RCompile/CRANpkg/extralibs64/local/lib -LC:/PROGRA~1/R/R-31~1.2/bin/i386 -lR 
# installing to D:/Copy/R/win-library/3.1/tsDyn/libs/i386 
# 
# *** arch - x64 
# gcc -m64 -I"C:/PROGRA~1/R/R-31~1.2/include" -DNDEBUG  -I"d:/RCompile/CRANpkg/extralibs64/local/include"  -O2 -Wall -std=gnu99 -mtune=core2 -c llar.c -o llar.o 
# gcc -m64 -I"C:/PROGRA~1/R/R-31~1.2/include" -DNDEBUG  -I"d:/RCompile/CRANpkg/extralibs64/local/include"  -O2 -Wall -std=gnu99 -mtune=core2 -c misc.c -o misc.o 
# gcc -m64 -I"C:/PROGRA~1/R/R-31~1.2/include" -DNDEBUG  -I"d:/RCompile/CRANpkg/extralibs64/local/include"  -O2 -Wall -std=gnu99 -mtune=core2 -c search.c -o search.o 
# gcc -m64 -shared -s -static-libgcc -o tsDyn.dll tmp.def llar.o misc.o search.o -Ld:/RCompile/CRANpkg/extralibs64/local/lib/x64 -Ld:/RCompile/CRANpkg/extralibs64/local/lib -LC:/PROGRA~1/R/R-31~1.2/bin/x64 -lR 
# installing to D:/Copy/R/win-library/3.1/tsDyn/libs/x64 
# ** R 
# ** data 
# ** inst 
# ** tests 
# ** preparing package for lazy loading 
# ** help 
# *** installing help indices 
# ** building package indices 
# ** installing vignettes 
# ** testing if installed package can be loaded 
# *** arch - i386 
# *** arch - x64 
# * DONE (tsDyn) 

library(tsDyn) 
tsDyn::autopairs 

# function (x, lag = 1, h, type = c("levels", "persp", "image", 
#  "lines", "points", "regression")) 
# { 
#  panel <- list(levels = function() sm::sm.density(X, h = rep(h, 
#   2), xlab = xlab, ylab = ylab, main = "density", display = "slice"), 
#   persp = function() sm::sm.density(X, h = rep(h, 2), xlab = xlab, 
#    ylab = ylab, main = "density", display = "persp"), 
#   image = function() sm::sm.density(X, h = rep(h, 2), xlab = xlab, 
#    ylab = ylab, main = "density", display = "image"), 
#   lines = function() plot(X, xlab = xlab, ylab = ylab, 
#    main = "lines", type = "l"), points = function() plot(X, 
#    xlab = xlab, ylab = ylab, main = "scatter"), regression = function() sm::sm.regression(X[, 
#    1], X[, 2], h = h, xlab = xlab, ylab = ylab, main = "regression", 
#    ask = FALSE)) 
#  lags <- c(-lag, 0) 
#  X <- embedd(x, lags = lags) 
#  xlab <- paste("lag", lag) 
#  ylab <- paste("lag", 0) 
#  type <- match.arg(type) 
#  if (missing(h)) { 
#   h <- sm::hnorm(X)[1] 
#  } 
#  panel[[type]]() 
# } 
# <environment: namespace:tsDyn> 

Answer 2

您可以通过在防火墙后面工作时设置代理来避免此问题。从Rstudio安装代理的说明位于Link。

1. 检查您的IT管理员应该使用哪个代理访问内部网络上的任何HTTP/HTTPS代理？在大多数情况下，这将是 HTTP - http://proxy.companydomain:8080 HTTPS - https://proxy.companydomain:8080
2. 找到Renviron.site文件。一个我的Windows 10，我找到它在C:\Users\yourid\Documents\R\R-3.4.3\etc。在Linux中它有所不同。

3. 使用文本编辑器打开Renviron.site并粘贴您的代理。保存文件并重新启动[R

   options(Internet.info = 0) 
   http_proxy=http://proxy.companydomain:8080/ 
   https_proxy=https://proxy.companydomain:8080/ 
   

4. 就我而言，我设置了代理，这是unsupported proxy ....libcurl is built without the HTTPS-proxy support.后有另一个错误。因此，我将第二行改为http://而不是https://。这工作没有任何错误。

   https_proxy=http://proxy.companydomain:8080/ 
   

   希望这有助于。设置代理有点容易，让事情自动化。