使用ggplot2包将图例添加到“geom_bar”

Question

我是R的新手，所以请原谅我的无知。我做了一个伪堆叠的barplot，其中我使用geom_bar在彼此的顶部绘制了4组条。三种橡树（QUAG，QUKE，QUCH）有4种健康状况类别（活着，死亡，感染，& sod-dead）。

我的代码如下：

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x <- as.data.frame(list(variable=c("QUAG", "QUKE", "QUCH"), alive = c(627,208,109), infected = c(102,27,0), dead = c(133,112,12), sod.dead=c(49,8,0))) 

x.plot = ggplot(x, aes(variable, alive)) + geom_bar(fill="gray85") + 
    geom_bar(aes(variable,dead), fill="gray65") + 
    geom_bar(aes(variable, infected), fill="gray38") + 
    geom_bar(aes(variable, sod.dead), fill="black")+ 
    opts(panel.background = theme_rect(fill='gray100')) 
x.plot 

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现在我想打一个传奇，显示其灰色遮阳涉及到树状态，即“gray65”是“死树“等等，我一直在尝试过去的一小时，并且无法实现它的工作。

Answer 1

您需要重新整理数据。

library(reshape) 
library(ggplot2) 

x <- as.data.frame(list(variable=c("QUAG", "QUKE", "QUCH"), alive = c(627,208,109), infected = c(102,27,0), dead = c(133,112,12), sod.dead=c(49,8,0))) 

x <- melt(x) 
colnames(x) <- c("Type","Status","value") 

ggplot(x, aes(Type, value, fill=Status)) + geom_bar(position="stack") 

Answer 2

我看到@Brandon Bertelsen已经发布了一个很好的答案。我想补充一些代码，解决了原来的帖子中提到的其他详细信息：

1. 你重塑你的数据和健康状况映射到fill后，ggplot会自动创建的传说。
2. 我建议使用scale_fill_manual()来获得原始帖子中提到的确切灰色。
3. theme_bw()是一种方便快捷的功能，可以快速将黑白相片呈现给您的情节。
4. 可以通过指定levels参数factor()的参数指定所需的顺序来控制因子级别/颜色的绘制顺序。
5. 躲闪的barplot（而不是堆叠）可能对此数据集有一些优点。

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library(reshape2) 
library(ggplot2) 

x <- as.data.frame(list(variable=c("QUAG", "QUKE", "QUCH"), 
         alive=c(627, 208, 109), infected=c(102, 27, 0), 
         dead=c(133, 112, 12), sod.dead=c(49, 8, 0))) 

# Put data into 'long form' with melt from the reshape2 package. 
dat = melt(x, id.var="variable", variable.name="status") 

head(dat) 
# variable status value 
# 1  QUAG alive 627 
# 2  QUKE alive 208 
# 3  QUCH alive 109 
# 4  QUAG infected 102 
# 5  QUKE infected 27 
# 6  QUCH infected  0 

# By manually specifying the levels in the factor, you can control 
# the stacking order of the associated fill colors. 
dat$status = factor(as.character(dat$status), 
        levels=c("sod.dead", "dead", "infected", "alive")) 

# Create a named character vector that relates factor levels to colors. 
grays = c(alive="gray85", dead="gray65", infected="gray38", sod.dead="black") 

plot_1 = ggplot(dat, aes(x=variable, y=value, fill=status)) + 
     theme_bw() + 
     geom_bar(position="stack") + 
     scale_fill_manual(values=grays) 

ggsave(plot=plot_1, filename="plot_1.png", height=5, width=5) 

# You may also want to try a dodged barplot. 
plot_2 = ggplot(dat, aes(x=variable, y=value, fill=status)) + 
     theme_bw() + 
     geom_bar(position="dodge") + 
     scale_fill_manual(values=grays) 

ggsave(plot=plot_2, filename="plot_2.png", height=4, width=5)