Pytables检查列是否存在

是否可以使用Pytables（或Pandas）来检测hdf文件的表是否包含某个列？加载我使用的hdf文件：Pytables检查列是否存在

from pandas.io.pytables import HDFStore 
# this doesn't read the full file which is good 
hdf_store = HDFStore('data.h5', mode='r') 
# returns a "Group" object, not sure if this could be used... 
hdf_store.get_node('tablename')

我也可以直接使用Pytables而不是Pandas。目的不是加载hdf文件的所有数据，因为这些文件可能很大，我只想确定是否存在某个列。

来源

2016-07-12 orange

试试这个：'hdf_store [“表名”] columns' – MaxU

这需要很长的时间才能完成（3GB HDF文件），所以我想这是拉动完整的文件。但它返回列。 – orange

我可能找到了一个解决方案，但我不确定（1）它为什么起作用，以及（2）这是否是一个可靠的解决方案。

import tables 
h5 = tables.openFile('data.h5', mode='r') 
df_node = h5.root.__getattr__('tablename') 
# Not sure why `axis0` contains the column data, but it seems consistent 
# with the tested h5 files. 
columns = df_node.axis0[:]

columns包含numpy阵列与所有的列名。

来源

2016-07-12 08:07:08 orange

这很聪明！这里是一个熊猫的等价物：'pd.HDFStore（'data.h5'）。get_node（'tablename'）。axis0 [：]' – MaxU

Pandas 0.20.3和PyTables 3.3.0（HDF文件是使用Pandas创建的）接受的解决方案对我无效。然而，这个工程：

pd.HDFStore('data.hd5', mode='r').get_node('/path/to/pandas/df').table.colnames

来源

2017-08-13 14:32:05

Pytables检查列是否存在

回答

相关问题