igraph R顶点ids变更

我对igraph（R）有非常基本的问题：重命名节点ID。igraph R顶点ids变更

例如，我有以下图形的边界列表。

我想计算每个节点的局部聚类系数。首先，我使用readcsv阅读了对象g中的边界列表。然后，我使用以下命令为每个节点转储本地CC。

write.csv(transitivity(g,type="local"),file="DumpLocalCC.csv")

现在的问题是，改变的igraph节点ID从1开始，我得到以下输出

"","x" 
"1",NA 
"2",0.333333333333333 
"3",0.333333333333333 
"4",0.333333333333333 
"5",1 
"6",1 
"7",1

现在我怎么能百忍哪个节点ID是什么？也就是说，如果输出文件中的7指向100或34？无论如何，我们可以强制igraph转储像10,34,100等实际节点和它们各自的本地CC？

我是谷歌搜索，发现人们建议“V（g）$ name < - as.character（V（g））”来保存nodeids。然而，我尝试过，我认为我没有正确使用它。此外，由于数据量很大，我不想手动更改节点ID以使它们从1 ...开始连续。

P.s：Here我注意到一个类似的问题已经被问到。有人建议“将这些数字分配为顶点名称”。如何做到这一点？有人可以举例说明吗？

另一个类似的问题，如this（我了解它的类似问题），其中有人建议打开一个问题。我不确定这是否已经解决？

在此先感谢。

来源

2017-05-17 raj

它会更容易帮助你，如果你提供了正确的[重复的例子（http://stackoverflow.com/questions/5963269/how-to-make-a-great-r-reproducible例如）用代码我们可以复制/粘贴到R中进行测试。准确显示如何创建图形对象。 – MrFlick

已提供边缘列表。我使用以下代码来读取它 DF < - read.csv（“EDGELIST.csv的路径”） g < - graph.DF（advice_data_frame）和以上我提供了如何计算聚类系数（传递性）和将其倾倒在文件中 – raj

您只需在编写表时将统计信息与节点名称结合使用。例如

DF <- read.csv(text="10,12 
    10,14 
    12,14 
    12,15 
    14,15 
    12,17 
    17,34 
    17,100 
    100,34", header=FALSE) 
g <- graph.data.frame(DF) 
outdata <- data.frame(node=names(V(g)), trans=transitivity(g, type="local")) 
write.csv(outdata, file="DumpLocalCC.csv")

来源

2017-05-17 19:21:23 MrFlick

谢谢！这解决了这个问题。 – raj

igraph R顶点ids变更

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