R中

2011-08-07 57 views -1 likes

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我有以下矩阵创建热图想R中创建热图R中

E1 E2 P1 P2 
E1 1 0.73867 0.865486 0.708944 
E2  1 0.749623 0.949532 
P1   1 0.747194 
P2    1

我用下面的代码来实现它

acc<-read.csv("data.csv",header=TRUE,sep=",") 

row.names(acc)<-acc[,1] 

acc <- acc[,2:dim(acc)[2]] 

acc_matrix<-data.matrix(acc) 

acc_map <- heatmap_2(acc_matrix,Rowv=NA, Colv=NA, col = rev(heat.colors(256)),scale="none",legend=1)

但即时得到错误如下

Error in `[.data.frame`(acc, , 1:dim(acc)[1]) : 
    undefined columns selected

任何人都可以请帮助如何解决这个问题...

感谢

来源

2011-08-07 nit

不heapmap_2住在什么包？ – Chase

发生哪些线路错误？什么是'heatmap_2'？错误发生后，你可以使用'traceback（）'来查看有关错误的更多详细信息。 – Marek

也粘贴'dput（acc）'的结果会很有帮助。 – Chase

回答

下面是一个使用ggheat功能的解决方案。

mat <- matrix(NA,ncol=4,nrow=4) 
diag(mat) <- 1 
library(gdata) 
upperTriangle(mat) <- runif(6) 
colnames(mat) <- rownames(mat) <- c("E1","E2","P1","P2") 
ggheat(mat)

ggheat

来源

2011-08-07 12:46:43

R中

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