NetworkX：在图层中绘制图形

Question

我有一个在图层上分割的图形，即f.e. ：

ids : 0 - 100 are lowest level 
ids : 101 - 500 are level 2 
ids : 501 - 1500 are level 3 
and so on ... 

是否有某种方法可以强制图形绘制图层中的节点，一个在另一个上面。

我想堆叠起来没有溢出:)

在我的情况在该层中，节点是依赖于节点ID，但它可能是一些其他的组织原则，如果你有一些想法。

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这到目前为止似乎是可能的解决方案：

def plot(self): 
    plt.figure() 
    pos = nx.graphviz_layout(self.g,prog='dot') 
    nx.draw(self.g, pos, node_size=650, node_color='#ffaaaa') 

五层例如...

Answer 1

布局功能，如nx.spring_layout，返回一个字典，它的键是节点，其值是2元组（坐标）。这里的pos字典可能看起来像一个例子：

In [101]: pos 
Out[101]: 
{(0, 0): array([ 0.70821816, 0.03766149]), 
(0, 1): array([ 0.97041253, 0.30382541]), 
(0, 2): array([ 0.99647583, 0.63049339]), 
(0, 3): array([ 0.86691957, 0.86393669]), 
(1, 0): array([ 0.79471631, 0.08748146]), 
(1, 1): array([ 0.71731384, 0.35520076]), 
(1, 2): array([ 0.69295087, 0.71089292]), 
(1, 3): array([ 0.63927851, 1.  ]), 
(2, 0): array([ 0.42228877, 0.  ]), 
(2, 1): array([ 0.33250362, 0.3165331 ]), 
(2, 2): array([ 0.31084694, 0.69246818]), 
(2, 3): array([ 0.34141212, 0.9952164 ]), 
(3, 0): array([ 0.16734454, 0.11357547]), 
(3, 1): array([ 0.01560951, 0.33063389]), 
(3, 2): array([ 0.  , 0.63044189]), 
(3, 3): array([ 0.12242227, 0.85656669])} 

然后，您可以操纵这些坐标进一步，任何方式都可以。例如，由于在 和x坐标y通过spring_layout返回是0和1之间，则可以 10倍层等级值添加到y - 协调到节点分离成层：

for node in pos: 
    level = node // nodes_per_layer 
    pos[node] += (0,10*level) 

---

import networkx as nx 
import matplotlib.pyplot as plt 

layers = 5 
nodes_per_layer = 3 
n = layers * nodes_per_layer 
p = 0.2 

G = nx.fast_gnp_random_graph(n, p, seed=2017, directed=True) 
pos = nx.spring_layout(G, iterations=100) 

for node in pos: 
    level = node // nodes_per_layer 
    pos[node] += (0,10*level) 

nx.draw(G, pos, node_size=650, node_color='#ffaaaa', with_labels=True) 
plt.show() 

产生