使用Networkx绘制带有边缘的图形

我一直很困扰一些非常简单的事情。我试图绘制并显示2个节点和1个边的图。但是，我得到这个错误：使用Networkx绘制带有边缘的图形

Traceback (most recent call last): 
File "<stdin>", line 1, in <module> 
File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 133, in  draw 
draw_networkx(G,pos=pos,ax=ax,**kwds) 
File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 267, in draw_networkx 
edge_collection=draw_networkx_edges(G, pos, **kwds) 
File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 546, in draw_networkx_edges 
ax.add_collection(edge_collection) 
File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/matplotlib/axes.py", line 1445, in add_collection 
self.update_datalim(collection.get_datalim(self.transData)) 
File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/matplotlib/collections.py", line 167, in get_datalim 
offsets.shape = (-1, 2)      # Make it Nx2 
AttributeError: incompatible shape for a non-contiguous array

这很简单，我只加2个节点与

add_node(1) 
add_node(2) 
add_edge(1,2)

，然后绘制并显示它。但我不能让它工作。

来源

2012-10-28 WYS

我有与Python 3.3相同的问题，来自github的NumPy（Python 3.3/PEP 393兼容性需要）和matplotlib 1.2.0rc2。当使用python 2.6.6，numpy 1.6.2和matplotlib 1.1.1时，它工作正常。 – Olson

@olson是对的，这是一个NumPy错误，希望很快就会解决https://github.com/numpy/numpy/issues/2700 – Aric

嗯，我会尝试使用旧版本。但后来我需要创建一个virtualenv ...嗯...将尝试...谢谢无论如何:) – WYS

import networkx as nx 
g=nx.Graph() 
g.add_node(1) 
g.add_node(2) 
g.add_edge(1,2) 
nx.draw(g)

来源

2012-10-28 21:56:06 root

不能在Ubuntu的ipython上工作。 – VaidAbhishek

这是一个有效的解决方案。

import matplotlib.pyplot as plt 
import networkx as nx 

# Create a basic Graph 
g=nx.Graph() 
g.add_node(1) 
g.add_node(2) 
g.add_edge(1,2) 

# Output the result 
nx.draw(g) 
plt.show()

来源

2014-05-09 08:57:14

使用Networkx绘制带有边缘的图形

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